碱基周报(第 002 期):申请国家自然科学基金

封面图源:pexels.com

记录每周值得分享的生命科学和生物信息学进展内容,周日发布。

本周话题:申请国家自然科学基金

这周在国内很多科研人员来说,最重要的一个事情就是国家自然科学基金(简称:国自然)的申请,每年都在三月份中旬提交。通常都要花很长时间寻找科学问题、准备素材和前期结果,之后还要写好项目标书,所以几乎每个有意申请的科研人员都很难过好春节,而且每年如此。国自然对于每个科研人员来讲意义很大,它就像是科研人员的“高考”,特别是对于进入科研圈的新人来说更是如此,可以认为是一个标志,所以特别重要。下面是2020年生命科学部中标率(资助率)的一个统计:

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这个是2020年医学科学部中标率的统计:

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中标率差不多是15%-20%,这两个学部相对来说,生命科学部比起医学科学部的中标率还是要高不少的(大约高6%-7%)。另外,发现在信息科学部下面其实也有两个生物信息学的分支,这并不算意外,因为生物信息学其实也是一门信息科学。


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去年我申请的是青年科学基金,在过会的时候被毙掉了:有谁和我一样,国自然五个评委意见中只有一个不赞同,但最后却还是没中的吗?今年要重新申请,但难度更大了,而且我这次写的并不顺利。去年的课题没有中标国自然,后来重新投中了其他的基金,不过在科研圈中,国自然基金是一个不可以绕开的门槛。

文章和资讯

1、睡觉打鼾的人,大脑中出现与阿尔兹海默症相同的损伤,或是老年痴呆前兆?

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首先,我们熟知的睡觉打鼾是临床上称为阻塞性睡眠呼吸暂停综合征(OSAS)的一个常见特征。OSAS是由于身体的某些机能异常引起的,是一种不该被忽视的疾病。这项研究的厉害之处是,研究人员竟然建立起了阿兹海默疾病(老年痴呆)和OSAS之间的联系,他们的成果第一次发现了OSAS和阿尔兹海默症患者一样,大脑中也会出现淀粉样蛋白沉淀,而且这些沉淀斑块出现在与阿尔兹海默症患者相同的大脑位置中,并以相同的方式传播。这项成果的结论是:一个人如果中年时有睡眠呼吸暂停(最直观的表现就是睡觉打鼾),那么他年龄更大时更可能患上阿尔兹海默症;如果一个人已经患上阿尔兹海默症,那么他往往比同龄人更易出现睡眠呼吸暂停。看了这个研究后,我不禁陷入了沉思......

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强调一下:睡觉打鼾并不代表一定就患有阻塞性睡眠呼吸暂停,打鼾只是阻塞性睡眠呼吸暂停的一个最明显特征。

2、全世界每年120万人死于肝癌,每天两杯咖啡,因肝癌而死亡的人数将减少数十万

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咖啡可以降低肝癌发病率。其实我看到这样的结论时,并不是很意外,因为一直以来都不断有研究在说,定期喝咖啡有益健康。这篇论文也提到,很多证据提示饮用咖啡不会增加心血管疾病和癌症风险,而且每日饮用3~5杯咖啡与数种慢性疾病风险降低相关。但从目前统计数据来看,全世界每人每天平均不足一杯,欧洲的斯堪的纳维亚半岛最多,平均大于四杯;其次是欧洲、南美、澳大利亚及新西兰地区,每人每天大于两杯。这个研究的结论是:如果世界上每人每天能至少喝两杯咖啡,那么全世界因肝癌而死亡的人数将至少减少45万,这个数字其实已经非常可观!而如果每人每天能喝四杯咖啡以上,那么因肝癌而死亡的人数则将减少72万以上!看到这个结论时,我就想这个要真有能力做到,岂不是利好全社会?当然首先是利好星巴克和瑞幸咖啡,但要是工作更有精神了,生产力不也更足么?而且更多人健康了,996福报,推而广之不也利好所有企业——也就是利好全社会呀,哈?

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另外值得一提的是,2020年国内医学科学院阜外医院顾东风院士(现任南方科技大学代理副校长)团队在《欧洲预防心脏病学杂志》发表论文称,通过对>10万名健康中国人的长期跟踪研究之后发现,每周喝三次茶以上与更健康和更长的预期寿命有关,也就是说中国人适量饮茶其实对健康也同样有好处。

3、喝咖啡不会影响睡眠,但却改变了大脑结构

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还是一项关于咖啡的研究,这是一项“随机双盲交叉试验”,它的科学性和可信度应该说是很有保障的,不过样本量有些小,只有20个志愿者。分了两个组,做了两个10天(共20天)的对比研究。期刊的影响因子也不是特别高:2020 IF 5.043。这项研究的发现是,经常喝咖啡(含咖啡因)并不会影响睡眠质量,但它会改变与记忆有关的大脑结构,而且对认知功能是偏负面的影响。他们发现咖啡因会减少大脑灰质的体积。不过,这种影响似乎又是暂时的,停喝之后灰质就又增加回去了。

灰质是中枢神经系统的重要组成部分,由大量的神经元胞体及其树突聚集在一起形成,灰质和人的认知能力有关;另一个重要组成部分为白质,它由各种不同功能的神经纤维聚集而成。

这个研究样本量还是太少了,代表性不足,说服力不是很强,而且缺少一组平时不喝咖啡的对照。所以咖啡喝多了到底会不会“智障”,还有待进一步做大规模的系统研究。

嘿,2 和 3 的研究还真有趣。

4、中国人独立起源,不是来自非洲?

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非凡的结论必须要有非凡的证据。

我们的祖先是谁,他们从哪儿来?学界从未停止过对于人类自身起源的探寻,诞生过“多地起源假说”和“非洲起源假说”,目前主流是非洲起源假说。学界一直关心现代东亚人的起源问题,想看看是否有“特殊”之处,找出非洲起源假说的漏洞,有时确实会找到一些蛛丝马迹,但随后的进一步研究总是会推翻原来的结论。这里两篇顶刊论文结论相互打架,彼此都不能说服彼此。

对我而言,我偏向于认为东亚人/中国人和世界上其他群体一样,都起源于非洲,而且东亚人是一个更加年轻的群体,这方面在古DNA研究上已经有所证明了。我之前还专门写了一篇关于通过古DNA研究中国人起源的文章: 科普 | 古DNA研究如何揭示中国人的起源?

5、长大后吸掉了自己的脑子,这种动物味道不错讲一个细思极恐的事情:大脑告诉我们,脑子是人体最重要的器官,地球上聪明的动物都有脑子。

就连上面这句话,都是脑子让说出来的......

然而,地球上有一种动物,长大后脑子就不见了。这种动物就是:海鞘(如图)。

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而且它们属于尾索动物亚门,和脊椎动物拥有共同的祖先,四舍五入就是人类祖先的近亲了。不过,刚出生几天的小海鞘也是有脑子的,只是后来发生了逆行变态,在一天之内原本的背神经管、眼睛和大部分尾巴都会被吸收,脑子也基本消失了,最后就保留了一个连接嘴巴和心脏、主要功能是控制进食的神经节,成了一个“无头怪”。

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这真是一个有趣的事情,不过研究发现海鞘的无脑化可能是后期演化新出现的,而且不是所有海鞘最终都无脑,比如“不愿意长大”的尾海鞘就有脑子。海鞘的另一个特殊特征是有非常特殊的血液成分,一些海鞘的血细胞由于含有钒绑定蛋白(Vanabins),这类海鞘的血液是绿色的!而且,海鞘的超强身体复原能力(吃掉一块也能复原——没错不少海鞘都是可食用的)可能就和它们的特殊血液有关。

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6、“吃掉你,我就继承你的记忆”,记忆转移实验是造假还是奇迹?

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涡虫,一种原始的扁形动物,大多生活在水中.(图片来源: Christopher Laumer | Wikimedia Commons)千百年来,人类一直将记忆视为心智中最私密、最自我的角落。如果记忆可以像血液或器官一样在个体之间传递,那么社会框架、伦理规则都将被打破。知识分子上这篇文章记录上个世纪一名科学家——麦康诺博士(James V. McConnell)利用涡虫探究记忆是否可以移植的过程。当然这个结果最终是假的,但1962年他的研究成果把生物学界搅得天翻地覆,各种扯皮,甚至连“研究人员的个性会影响实验成败”的这种理由也拉出来了。虽然结果乏善可陈,但这个打假的过程却又耐人思考,这一点“知识分子”在文章的末尾也已言明。

相比一锤定音式的权威裁决,我们是否应该也让更多科学家和公众参与到辩论中来?

7、分析数十万人数据,找到62个“护胖”基因

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Huang L O, Rauch A, Mazzaferro E, et al. Genome-wide discovery of genetic loci that uncouple excess adiposity from its comorbidities[J]. Nature Metabolism, 2021, 3(2): 228-243.

这是上个月 Nature Metabolism 上发表的一项研究。它发现了62个与体脂更高,但心血管代谢疾病风险却更低的相关基因位点,也就是神奇的“胖而无病”!这个奥秘的揭开和未来的治疗方法,可能就藏在这些基因里面。这个研究团队收集了11个公开的 GWAS 数据资料,纳入的样本量在5-33万人之间,信息量十分庞大,然后直接开展 GWAS-Meta 分析,最后再用 UKBiobank 的数据实现了验证。这62个基因位点可以分为三组,第一组是有“多重代谢保护作用”的位点,其中7个与更好的体脂分布状况有关;第二组则是与“好胆固醇” HDL-C 较高、“坏胆固醇” LDL-C 和甘油三酯更低有关;第三组则主要与体重指数高、空腹血糖和收缩压更低有关。这62个基因位点还与人体脂肪细胞内基因表达有变化的位点高度重合,所以它们很可能是通过影响脂肪细胞的生物学行为发挥作用,比如影响了能量代谢和氧化还原、胰岛素-血糖信号通路、白色脂肪棕色化和慢性炎症等。

References

[1] https://mp.weixin.qq.com/s/Lu4QOJ6zTTRf61mfoRUhkg
[2] https://mp.weixin.qq.com/s/xcc_hNBSe151Oc2jVRxcKQ
[3] https://mp.weixin.qq.com/s/WaJ7636hOUY0RQe2YdFVIA
[4] https://mp.weixin.qq.com/s/St-ykjS23ZDixFN1y1wZfg
[5] https://mp.weixin.qq.com/s/ph4R2MMz7EMMIPl_lNF8YA
[6] https://mp.weixin.qq.com/s/ph4R2MMz7EMMIPl_lNF8YA
[7] https://mp.weixin.qq.com/s/23uUN93Emh52qfoyk7qkLg


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