R数据分析:嵌套数据分析为什么要用加随机效应?终于解释清楚了

自己已经写了好几篇关于随机效应模型的文章了,今天换个角度,从传统回归和随机效应模型的对比中模拟出两模型真正的差异,让你明白加上随机效应到底对模型会有什么样的改变。

回顾

在传统的回归中,我们有如下式子:

yj = βxj+ εj

就是说x与y之间的关系是β。

但现在,我们有一个纵向数据,比如说我有30个人,每个人测xy均测量15次,那么有可能会存在每个人中xy的关系不一样的情况。

这个很好理解,毕竟人与人之间是有差异的。那么如果真的是这样,我们对于每个人都可以拟合出一个βi,如果每个人中xy关系的基线水准也不一样,那么可能我们每个人的xy关系上会有一个特定且不一样的截距αi。

然后,我们的式子变成了:

yij = αi + βixij + εij

上面这个式子就是最简单的随机效应模型。其中αi为随机截距,βi为随机斜率。

image

R模拟

现在我模拟30个人,每个人测量xy15次:

J <- 15
N <- 30

test.df <- data.frame( unit = sort(rep(c(1:N),J)), 

                       J = rep(c(1:J),N) , x = rnorm(n = J*N) )
beta <- 3 + .2*rnorm(N)

test.df$beta <- beta[test.df$unit]
test.df$y <- 1 + test.df$x * test.df$beta + .75*rnorm(n = J*N)
head(test.df, 18)

上面的代码产生了30个人,每个人有xy的测量15次,xy的关系服从以3为均值,0.2为标准差的正态分布,每个人中xy的关系都不一样:

image

在上面的数据中,我们有两个水平,第一个水平是xy的测量,第二个水平是人,xy是嵌套在人的水平上的。

一般线性回归

因为我们知道每个人xy关系是不一样,所以我们分人做个回归,这么一个做法是一般线性回归对多水平嵌套数据能做到的极限了:

beta.hat <- list()
for(i in 1:N){
  unit.lm <- lm(y ~ x, data = subset(test.df, unit == i) )
  beta.hat[i] <- coef(unit.lm)[2]
}
beta.hat <- as.numeric(beta.hat)

上面的代码就可以得到每个人中xy的关系βi:

我们看一看我们用一般线性回归估计出来的βi和我们本来模拟的有什么差异:


par(mfrow = c(2, 1))
hist(beta, main = "XY真实的斜率", col = "blue",

     xlab = expression(beta[i]), cex.axis = 1.5, cex.lab = 1.5,

     breaks = seq(from = 2.4, to = 3.6, by = .1) )

hist(as.numeric(beta.hat), main = "一般线性回归估计的斜率",

     xlab = expression(hat(beta)[i]), col = "blue", cex.axis = 1.5,

     cex.lab = 1.5, breaks = seq(from = 2.4, to = 3.6, by = .1) )
image

可以看出来估计的斜率分布变异比真实斜率更大一点。此时,我们并不能说xy的关系到底如何,因为我们拟合了30个β,虽然这个β的分布和真实的分布差不太多(其实变异稍大),我们无法得出真实的xy之间的关系,你说到底30个β到底选哪个?。

再看随机效应模型

在R中建立随机效应模型需要用到lme4这个包,随机效应部分一般表达为:

(formula for random terms | unit for which these terms apply).

在 | 的左边你可以设定随机截距或者随机斜率,在右边需要设定随机效应的水平;如果x有随机截距和随机斜率,你就可以设定左边为“1+x”,如果x只有随机斜率没有随机截距,你设定左边为“0+x”,因为随机效应都是在高水平上的变异,所以在 |右边你就应该将这个水平指定出来,在本例中人为高水平,对应的变量为数据库中的unit,所以我们将右边设定为unit。

那么对于本例的混合效应模型我们可以写出代码:

library(lme4)
re.lm <- lmer(y ~ x + (1+x|unit), data = test.df) 
summary(re.lm)
image

上面的代码拟合了一个有随机截距和随机斜率的混合模型,此时我们得到x的固定效应为3.055,随机效应为0.116,和我们原先设定的xy的关系服从以3为均值,0.2为标准差的正态分布有点接近了。

但是我们原先并没有设定人水平上的截距的变异,大家回看原来的数据公式,其实我将所有个体的截距都固定为1的,所以对数据最正确的模型应该是随机斜率模型,如下:

re.lm <- lmer(y ~ x + (0+x|unit), data = test.df)
summary(re.lm)

[图片上传失败...(image-6a8cff-1612072903647)]

这次,大家再看,我们x的固定效应为2.98,随机效应为0.015,基本可原先xy的关系服从以3为均值,0.2为标准差的正态分布吻合了。即通过随机效应模型我们正确的得到了xy的真正关系。

我们可以查看我们拟合的每个人水平上的随机效应:

coef(re.lm)
image

30个人,每个人都有一个相同的截距和一个基本上以3为均值,0.2为标准差的斜率。

小结

今天再写一遍混合效应模型,大家应该会感觉更加清晰了,感谢大家耐心看完,自己的文章都写的很细,代码都在原文中,希望大家都可以自己做一做,如果对您有用请先收藏,再点赞转发,也欢迎大家的意见和建议。

如果你是一个大学本科生或研究生,如果你正在因为你的统计作业、数据分析、论文、报告、考试等发愁,如果你在使用SPSS,R,Python,Mplus, Excel中遇到任何问题,都可以联系我。因为我可以给您提供最好的,最详细和耐心的数据分析服务。

如果你对Z检验,t检验,方差分析,多元方差分析,回归,卡方检验,相关,多水平模型,结构方程模型,中介调节等等统计技巧有任何问题,请私信我,获取最详细和耐心的指导。

If you are a student and you are worried about you statistical #Assignments, #Data #Analysis, #Thesis, #reports, #composing, #Quizzes, Exams.. And if you are facing problem in #SPSS, #R-Programming, #Excel, Mplus, then contact me. Because I could provide you the best services for your Data Analysis.

Are you confused with statistical Techniques like z-test, t-test, ANOVA, MANOVA, Regression, Logistic Regression, Chi-Square, Correlation, Association, SEM, multilevel model, mediation and moderation etc. for your Data Analysis...??

Then Contact Me. I will solve your Problem...

加油吧,打工人!

往期内容:

R数据分析:混合效应模型实例

从“我丑到我自己了”说起——混合效应模型续

重复测量数据分析系列:混合效应模型基础

假设检验基础:α错误,β错误,样本容量,效应量的关系简介

R数据分析:中介效应的做法

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 205,236评论 6 478
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 87,867评论 2 381
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 151,715评论 0 340
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,899评论 1 278
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,895评论 5 368
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,733评论 1 283
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 38,085评论 3 399
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,722评论 0 258
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 43,025评论 1 300
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,696评论 2 323
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,816评论 1 333
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,447评论 4 322
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 39,057评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 30,009评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,254评论 1 260
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 45,204评论 2 352
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,561评论 2 343

推荐阅读更多精彩内容