1.设置CRAN镜像
options("repos"="https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/")
2.安装BiocManager
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("")
BiocManager::install(version = "3.12")
注意:BiocManager与Rstudio版本的对应关系,version = "3.12"适用于Rstudio4.0以上的版本
2.1 BiocManager安装R包
BiocManager::install("GEOquery")
2.2联网问题
## 打不开的 options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
3 无法联网,配置网络
options(download.file.method = 'libcurl')#第一种
options(download.file.method = 'libcurl')#第二种
options(url.method='libcurl')
4 批量安装R包,由于依赖包的关系,出现错误。
实在安装不上的就手动安装啦
我的问题是下载R包显示无法联网,试了很多方法,换了多个镜像也不可以,最后直接重装Rstudio按照上述的版本就可以了。不过下载速度还是有些慢,还有部分无法安装的就直接手动安装了。
还有就是由多个依赖包的时候,根据提示就缺啥补啥啦。
弄了好久,有点心塞,允悲。