阿米巴经营源于日本经营之圣——稻盛和夫。稻盛先生1959年创立京都陶瓷株式会社之后，公司迅速成长壮大，1965年，京瓷员工规模超过200人，稻盛先生既要管研发，又要管生产，还要管销售，身心疲惫，无法支撑。这样他苦苦寻求一个解决方案，有一天，他闲来阅读中国古典文学名著——《西游记》，看到孙悟空会七十二变，深受启发，原来企业成长壮大的秘诀在于经营人才的复制。
稻盛先生这样对他的阿米巴经营下了这样的定义：阿米巴经营是一种经营方法，也是一种组织形态，是在以牢固的经营哲学为基础，把组织划分成一个个的小团体，通过独立核算制加以运作，在公司内部不断培养具备经营者意识的人才，实现全体员工共同参与经营的全员参与型经营。
这体现了阿米巴经营模式的三大目的：
第一：独立核算，也就是化小组织单元，每个单元都算出利润；
第二：培养经营人才，通过独立核算这种手段，能有效地调动员工的经营意识，培养经营人才；
第三：全员参与，阿米巴经营的运营成功，标志就在于全员都参与进去，而阿米巴经营的核算单元化小，可以保证基层的阿米巴巴长可以关注到手下每一名员工，带动大家一起参与经营。
那么，为什么用阿米巴来命名这种经营模式呢？阿米巴的本意是单细胞的变形虫，多生活在水中，身体形状常变化，靠伪足运动或捕食。多为寄生性，有的可导致阿米巴病。阿米巴原虫的特点：
第一是单细胞，容易复制，对生存环境的要求极低；恐龙灭绝了，而阿米巴原虫在地球上生存了几十亿年，是生命力最强的生物体；
第二是团队精神。 阿米巴原虫的生存状态很有趣，此行为学术上称之为“阿米巴运动”。变形虫常在水底和潮湿的森林土壤上爬行。它们吞食细菌，每三四小时进食一次。别看它只有单细胞，它能做出人类——这个经过10亿年多细胞组织的缓慢进化和4百万年同样缓慢的演变形成大脑的物种——才能做到的事。
如果出现食物匮乏，挨饿的变形虫便开始发出一种化学信号，告诉同类，让它们到某个中心地点集合。不用多长时间，4至6万个单细胞便围聚在一起，形成一个团队，该整体被命名为“各列克斯”，形如一头脱壳的蜗牛，并以每小时一厘米的速度继续转移，而令人费解的事发生了。
这些变形虫能记住它们各自抵达集合地点的先后顺序，尽管没有记忆器官。首批到达的总是走在队伍的前头，带领大队人马前进。如果把它们调到队尾，它们会迅速重返队头。在寻找的路上，要是一无所获，它们就会改变原先的主意，一起营建一个酷似高塔上球体的建筑物。
第三是自我牺牲精神。
上述工程需要明确的分工和专业水平。但看不到谁在发号施令指挥整个工程的进度。变形虫既无触觉，也无语言，更无思想意识，它们不可能意识到各自所处的空间位置。但变形虫仿佛具有这些能力：那些迟到者会用它们的“躯体”筑成盘状基座，在基座架高的根茎则是由首先到达者构成的，最后一批前来报到的变形虫便沿着根茎攀登而上，在上方共同形成突出球囊。还有一部分变形虫就像搭乘马车的乘客一个个钻进球体内部，在那里 它们开始改变形状，形成胞囊。接着瑟缩体积，脱出水份，并分泌一层包膜作为保护性外膜 ，中止自身新陈代谢，最后变成一丁点大的“种子”。那些以“血肉之躯”筑成球状结构的变形虫注定要把自己推向死亡，它们会因缺乏食料而很快死去。而钻进球囊内部形成“种子”的变形虫过一段时间后，会因球囊破裂散落下来。假如一阵风吹过，它们又可获得降落在潮湿土地的机会，重新复活过来，重新摄食、分解、围成团队……
如果有一个组织，每个员工都是“打不死的小强”，不达目的，誓不罢休；组织的团队精神很强，每个人为了组织目标而共同奋斗；而在个人利益与组织利益冲突的时候，每个人都愿意牺牲个人利益保证团队利益的实现。这是一个什么组织？有恐怖战斗力的组织对吗？
正是因为这样的特点，稻盛先生用阿米巴来命名自己独创的这一套经营模式，在于培养经营人才，保证组织健康发展的基础上，追求利润最大化。
