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安装
从该网址下载其安装脚本:http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/
我一般都是保存在bin目录下,cd到该目录
运行命令行:
$ chmod +x faSomeRecords #赋予文件可执行权限,为Linux系统下执行
写到环境变量
echo export "PATH=~/bin/faSomeRecords/:$PATH" >> ~/.bashrc
. ~/.bashrc
vim 创作一个 保存基因名字的文件
faSomeRecords ref.cds.fasta id.txt query.fasta
在该目录下存储着参考基因组的cds文件,即ref.cds.fasta
图2是提取的结果。
------------------写在后面
非常实用的软件,用来提取目标基因序列,当然也包括蛋白,做法和提取基因的一样。