一、向量

1.向量与标量的区别

标量：一个元素
向量：一组元素

赋值

2. 从变量中提取元素

提取元素位置

x[4]   # x的第四个元素
x[-4]   # 除了第四个意外所有元素
 x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

根据值

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

数据框

1.读取本地数据
将本地数据放在工作目录里然后

read.table（file = "文件名",sep = "\t",header = T）
a<- read.table(file = "文件名",sep = "\t",header = T)

sep是分隔符的意思，不同格式的文件有不同的分隔符，比如csv的分隔符是逗号，
header是标题头，当其等于T时为真，标题头就不在数据框里。
2.设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

3.数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

4.变量的保存与重新加载

#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

5.提取元素

- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

6.使用数据框中的变量

提取两列作散点图

options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)

环境设置函数为options()，
stringsAsFactors = FALSE : 字符型数据读入时自动转换为因子，防止转换为因子，令参数stringsAsFactors = FALSE，防止导入的数据任何因子的转换。stringsAsFactors = T就正相反。

方法一：attach
将数据框名添加到搜索环境中：attach（a）,作图时就只需输入列名(连$都不用了)。

attach(a)
plot(case,values)

方法2：with

with(a,{
 plot(case,values)
x<<-summary(values)   #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x

回答问题：save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
可能原因：1.R里面是识别大小写的，x和X是两个不同的变量。当给小x赋值时，保存小x会出现大X没有被定义，找不到。

今日学习完成。