Immune Signature-Based Subtypes of Cervical Squamous Cell Carcinoma Tightly Associated with Human Papillomavirus Type 16 Expression, Molecular Features, and Clinical Outcome
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2019,May Neoplasia IF=3.837
基于免疫特征的宫颈鳞癌亚型与HPV16的表达、分子特征和临床预后密切相关
摘要
子宫颈癌内普遍存在异质性,通常被人乳头瘤病毒(HPV)感染。 但是,宫颈癌的最常见组织学亚型,宫颈鳞状细胞癌(CSCC),就其异质性与HPV癌蛋白表达之间的关联而言,其特征尚不明确。 我们仅过滤掉138例HPV16感染的CSCC样本; 然后我们将HPV16 E6 / E7表达压缩为HPVpca,并基于监督聚类将HPVpca与CSCC的免疫学分析相关联,以发现亚型,并在HPVpca水平,途径活性,表观遗传异常,体细胞突变频率, 以及对化学/免疫疗法有反应的可能性。 免疫标记的监督聚类揭示了与HPVpca和临床结果相关的两种HPV16亚型(即HPV16-IMM和HPV16-KRT)。 HPV16-KRT的特征是在角质化,生物氧化和Wnt信号传导中基因表达升高,而HPV16-IMM具有强大的免疫反应和间充质特征。 HPV16-IMM在FBXW7处表现出更多的表观遗传沉默和显着突变,而对于HPV16-KRT,MUC4和PIK3CA经常发生突变。 我们还推测,HPV16-IMM对化学/免疫疗法的敏感性比HPV16-KRT高得多。 我们的表征将HPV16 E6 / E7的表达与CSCC的生物学和临床结果紧密联系在一起,从而提供了有价值的分子水平信息,可指示解码异质性。 这些结果共同揭示了被HPV16感染的CSCC的分层,将有助于指导患者的个性化管理和治疗。
结论:
HPV16E6/E7高表达的患者可受益于免疫治疗