Conda安装
以 miniconda 为例, 谷歌搜索 ”conda 清华“,复制最新的miniconda 链接
wget link
这是一个 xxx.sh 文件加载完成,类似安装包。
bash miniconda-latest-xx.sh
最后一步,激活
source ~/.bashrc
安装完成!
添加镜像
# 使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
conda 常用指令
conda list #显示所有的软件
conda install fastqc=0.11.7 -y # 安装指定版本的fastqc,无需再询问
conda create -n day3 python=3 fastqc abricate -y 创建名字为day3的环境,指定python版本是3,安装fastqc 和abricate 两个软件,无需询问。
conda activate/deactivate day3
心得体会:以后我安装软件都要加上 -y