说明:这是一个机器学习实战项目(附带数据+代码+文档+代码讲解),如需数据+代码+文档+代码讲解可以直接到文章最后获取。
1.项目背景
在当今医疗健康领域,乳腺癌作为威胁女性健康的主要恶性肿瘤之一,其早期诊断与精准治疗对于提高患者生存率至关重要。随着医学信息学与人工智能技术的飞速发展,利用大数据分析、机器学习以及深度学习等先进手段构建乳腺癌分类预测模型,已成为研究热点和临床实践的重要方向。
近年来,全球乳腺癌发病率持续上升,成为全球范围内女性癌症发病率最高的疾病之一。尽管乳腺癌在早期发现时治疗效果较为理想,但传统的诊断方法如钼靶摄影、超声检查及组织活检等存在一定的局限性,如误诊率、漏诊率问题以及对患者造成的身体与心理负担。因此,开发高效、准确且便捷的乳腺癌分类预测模型,不仅能够提高诊断效率,还能促进个性化医疗方案的制定,为患者带来更为及时有效的干预措施。
研究意义:
提升早期诊断率:通过分析乳腺影像学、生物标志物、遗传学及临床数据,构建的预测模型能够有效识别乳腺癌早期迹象,为患者争取宝贵的治疗时间。
个性化医疗策略:结合患者的个体差异,预测模型能辅助医生定制化治疗方案,实现精准医疗。
资源优化配置:高效预测模型可减少不必要的检查和治疗,优化医疗资源分配,减轻公共卫生系统的负担。
促进科研进展:模型的开发与验证过程能够深化对乳腺癌生物学机制的理解,推动相关基础研究与技术创新。
基于以上背景,本研究拟采用先进的机器学习算法,结合丰富的乳腺癌临床数据集,构建一个高度准确且具有临床实用价值的乳腺癌分类预测模型。最终目标是为乳腺癌的早期筛查与精准管理提供科学依据,进而改善患者预后,提升公众健康水平。
本项目通过逻辑回归分类模型、决策树分类模型、随机森林分类模型和XGBoost分类模型实现乳腺癌分类预测。
2.数据获取
本次建模数据来源于网络(本项目撰写人整理而成),数据项统计如下:
数据详情如下(部分展示):
3.数据预处理
3.1 用Pandas工具查看数据
使用Pandas工具的head()方法查看前五行数据:
关键代码:
3.2数据缺失查看
使用Pandas工具的info()方法查看数据信息:
从上图可以看到,总共有31个变量,数据中无缺失值,共569条数据。
关键代码:
3.3数据描述性统计
通过Pandas工具的describe()方法来查看数据的平均值、标准差、最小值、分位数、最大值。
关键代码如下:
4.探索性数据分析
4.1 label变量柱状图
用Matplotlib工具的plot()方法绘制柱状图:
4.2 label=1样本mean radius变量分布直方图
用Matplotlib工具的hist()方法绘制直方图:
4.3 相关性分析
从上图中可以看到,数值越大相关性越强,正值是正相关、负值是负相关。
5.特征工程
5.1 建立特征数据和标签数据
关键代码如下:
5.2 数据均衡化
通过上图可以看到,数据均衡化后,标签两种样本的数量一致。
5.3 数据集拆分
通过train_test_split()方法按照80%训练集、20%测试集进行划分,关键代码如下:
6.构建分类模型
主要使用逻辑回归分类算法、决策树分类算法、随机森林分类算法和XGBoost分类算法,用于目标分类。
6.1 构建模型
7.模型评估
7.1评估指标及结果
评估指标主要包括准确率、查准率、查全率、F1分值等等。
从上表可以看出,4个模型的F1分值都在0.9以上,说明这模型效果较好,其中逻辑回归模型F1最高为0.9718。
7.2 分类报告
逻辑回归分类模型:
从上图可以看出,分类为0的F1分值为0.97;分类为1的F1分值为0.97。
决策树分类模型:
从上图可以看出,分类为0的F1分值为0.95;分类为1的F1分值为0.94。
随机森林分类模型:
从上图可以看出,分类为0的F1分值为0.97;分类为1的F1分值为0.96。
XGBoost分类模型:
从上图可以看出,分类为0的F1分值为0.97;分类为1的F1分值为0.96。
7.3 混淆矩阵
逻辑回归分类模型:
从上图可以看出,实际为0预测不为0的 有4个样本;实际为1预测不为1的 有0个样本。
决策树分类模型:
从上图可以看出,实际为0预测不为0的 有5个样本;实际为1预测不为1的 有3个样本。
随机森林分类模型:
从上图可以看出,实际为0预测不为0的 有2个样本;实际为1预测不为1的 有3个样本。
XGBoost分类模型:
从上图可以看出,实际为0预测不为0的 有2个样本;实际为1预测不为1的 有3个样本。
7.4 ROC曲线
逻辑回归分类模型:
从上图可以看出,逻辑回归分类模型的AUC值为1.0。
决策树分类模型:
从上图可以看出,决策树分类模型的AUC值为0.94。
随机森林分类模型:
从上图可以看出,随机森林分类模型的AUC值为0.99。
XGBoost分类模型:
从上图可以看出,XGBoost分类模型的AUC值为1.0。
8.结论与展望
综上所述,本文采用了逻辑回归、决策树、随机森林和XGBoost算法来构建分类模型,最终证明了4种模型效果良好,其中逻辑回归模型效果最优。此模型可用于日常产品的预测。
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项目代码:
# label变量柱状图
plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei'] # 指定默认字体
plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False # 解决保存图像是负号'-'显示为方块的问题
# kind='bar' 绘制柱状图
df['label'].value_counts().plot(kind='bar') # 绘图
plt.xlabel("label变量") # 设置x轴名称
# 绘制直方图 bins:控制直方图中的区间个数 auto为自动填充个数 color:指定柱子的填充色
plt.hist(data_tmp, bins='auto', color='g') # 绘图
# 项目资源如下:
# https://docs.qq.com/sheet/DTVd0Y2NNQUlWcmd6?tab=BB08J2
# 数据均衡化
from imblearn.over_sampling import RandomOverSampler, SMOTE # 导入过采样工具
model_SMOTE = SMOTE(random_state=0) # 建立过采样模型
x_SMOTE_resampled, y_SMOTE_resampled = model_SMOTE.fit_resample(X, y) # 过采样后样本结果
x_SMOTE_resampled = pd.DataFrame(x_SMOTE_resampled, columns=X.columns.values) # 构建DataFrame框架
y_SMOTE_resampled = pd.DataFrame(y_SMOTE_resampled, columns=['label']) # 构建DataFrame框架