1.标量和向量的区分
标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量
x<- c(1,2,3)
#常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
x
x<- 1:10
#从1-10之间所有的整数
x
x<- seq(1,10,by = 0.5)
#1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
x
x<- rep(1:3,times=2)
#1-3 重复2次
x
2.从向量中提取元素
(1)根据元素位置
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
(2)根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素
数据结构
(1)读取本地数据
X<-read.csv('doudou.txt')
read.table(file = "huahua.txt",sep ="\t",header =T)
a<-read.table(file ="huahua.txt",sep ="\t",header = T)
(2)设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt')
#在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X)
#查看列名
rownames(X)
#查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"
#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)
#最后row.names的意思是修改第一列为行名
file.choose():读入该文件,这样我们知道该文件的具体路径。
file参数: 路径和文件名,windows下用的是反斜杠\
head=T: 是首行问题,T表明文件有标题,将文件中的第一行作为列名。若head=F,则原来文件没有 标题,增加一行V1,V2,...作为文件的第一行,即作为列名。read.csv()函数默认为head=T。
sep=“,”: 分隔符问题,这里分隔符的选择会影响输入的被引用的字符串。
nrows=200: 行数问题,表明读取该文件的前200行。
stringsAsFactors = FALSE : 字符型数据读入时自动转换为因子,防止转换为因子,令参数stringsAsFactors = FALSE, 防止导入的数据任何因子的转换。
(3)数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)
(4)变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")
#保存当前所有变量
save(x,file="test.RData")
#保存其中一个变量
load("test.RData")
#再次使用RData时的加载命令
(5)提取元素
(6)【选修部分】直接使用数据框中的变量
options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)
环境设置函数为options(),用options()命令可以设置一些环境变量
stringsAsFactors = FALSE : 字符型数据读入时自动转换为因子,防止转换为因子,ringsAsFactors = FALSE, 防止导入的数据任何因子的转换。
data.frame()的使用
所以case=paste0("S",1:9)相当于横坐标的取值,values=runif(9)相当于纵坐标的取值
方法1:attach
将数据框名添加到搜索环境中:attach(a),作图时就只需输入列名(连$都不用了)。
attach(a)
plot(case,values)
问题:
Q:save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?
A:X应该是小写