上回说到起义军被老妪的所谓“驻军八百里”吓退，说明黄巢农民军已成强弩之末，气数将尽。
他们仍然流寇作战，到处打劫，不过总算进入长安，坐了一下金銮宝殿，然而屁股还没有焐热，就被官军赶出首都。由于属于流动作战，没有粮草供应，只能以人肉为粮。最后黄巢被官军追杀只剩下千把人马，黄巢知道自己的末日即将来临，妄图让外甥割取自己的首级换取荣华富贵，结果呢？
广明元年（唐僖宗李儇年号。880年），淮南高骈遣手下将领张潾度江败王重霸，降之。黄巢多次败退，退居饶州，部众发生瘟疫。另外一个将领常宏以所部数万人向官府投降，好多人被杀死。
各地官军捷报频传，实际上都是谎报军情，朝廷姑且信之，稍稍自安。黄巢得计，截杀张潾，陷睦、婺二州，又取宣州。而汉宏残众复奋，进而寇略宋州，抢掠申、光二州，前来与黄巢汇合，渡过采石矶，入侵扬州。
高骈按兵不动。下诏命令兗海节度使齐克让驻屯汝州，拜全晸天平节度使兼东面副都统。贼军方守滁、和二州，全晸发动天平兵击败贼军于淮上。宰相郑畋说：“援军未至，请假授黄巢天平军节度使，牵制他使他不能往西，然后以精兵守卫宣武，堵塞汝州与郑州之间的通道，这样就可以抓住贼首了。”宰相卢携坚执不可，并请求道：“号召诸道兵坚守泗水之上，以宣武军节度使统领他们，那么黄巢一定会回寇东南，徘徊于山东浙江之间，就可以拯救处于危险境地的官军”。皇帝下诏认可。
此前已下诏令天下兵驻屯溵水，防止贼军北走。于是徐州兵三千经过许昌，统帅薛能在徐州城里设立长官署，许昌人大惊说遭到袭击，部将周岌从溵水回来，杀死薛能，自称替代薛能。徐州军听说后立即暴乱，参将时溥也带领部队回来了，扣留军队头目支详。驻守兗海的齐克让恐惧下属叛乱，引军回到兗州，溵水驻屯军皆散去。黄巢听说以后，命令全军度过淮河，妄称“率土大将军”，整队伍不进行剽掠，所过之处惟征用壮丁补充兵员。
当时李罕之犯申、光、颍、宋、徐、兗等州，官吏皆已逃亡。黄巢进攻汝州，即将打到东都洛阳。这个时候，天子幼小，恐怖流泪，宰相共同建议，调动全部神策军和关内各个节度兵力十五万坚守潼关。田令孜请自带兵力向东。皇帝视察神策军，擢左军骑将张承范为先锋，右军步将王师会监督粮草，以飞龙使杨复恭协助田令孜。并在首都招募士兵，获得数千人。
但是实际情况令人忧虑，那些纨绔子弟仅仅是领取空饷，并不进行军事训练，都是用自己门人或雇佣别人冒充军人，坚守潼关，保住洛阳只能是纸上谈兵。正在此时，黄巢攻陷东都洛阳，洛阳留守刘允章带领百官向贼军投降。黄巢入城，慰劳问士卒百姓，里闾晏然。皇帝赐宴田令孜、章信，赏赐丰厚。但是卫兵都是长安高干子弟，世籍两军，得到赏赐，鲜衣怒马，震慑权贵，根本不懂军事，听说要调选上战场，都在家大哭，暗中出资雇佣商贩走卒以充行伍上阵，连兵器都不知道怎么拿，旁观者汗毛凛凛。承范以强弩三千防守潼关，临阵告辞说：“当年安禄山率领五万兵力攻陷东都洛阳，现在贼军六十万，远远超过安禄山，恐怕不能守住。”皇帝不许。贼军进取陕、虢，发出檄文对守关将士说：“我们不过是借道淮南，追逐高骈这个逃跑的老鼠，你们不用抗拒我们！”神策兵过华山，紧紧带了三日粮，吃不饱肚子，毫无斗志。
十二月，黄巢进攻潼关，齐克让带领军队战于关外，贼军稍稍退却。俄而黄巢至，军队齐声欢呼，川谷皆震，时士饥甚，暗中放火烧毁齐克让兵营，克让逃入关内。承范拿出黄金引诱将士说：“各位尽力报国，勇敢者有赏，救兵马上就到。”将士感动流泪，但是拒绝参战。贼军见援军不继，急忙攻关，官军矢尽，用石头砸向贼军，黄巢命令防火，关楼皆尽。当初，关左有大谷，禁止行人，号称禁谷。贼军至，田令孜把关，而忘记禁谷可入。尚让带领军队直驱禁谷，承范惶恐，师会紧急调动劲弩八百阻击，等到强弩运至阵地，贼军已进入禁谷。第二天，夹攻潼关，官军崩溃。师会欲自杀，承范说：“我们二人要是死了，谁帮我们辨解？还不如活着去见天子以实相告，再死不迟。”于是化妆逃跑逃。
开始，博野、凤翔军经过渭桥，见所招募军队个个服装鲜艳，百姓愤怒地说：“这是哪里来的勋功军队，这哪里能打仗！”于是都为贼军向导，焚烧西市。皇帝郊祭祈求上天保佑。承范至，实言相告首都不可守。皇帝罢黜宰相卢携。正在朝会，突然传言贼军至，文武百官四散奔逃，田令孜带神策兵五百护卫皇帝赶赴咸阳，只有福、穆、潭、寿四王和妃嫔一二随从，守卫西门的太监匡范统领右军殿后。黄巢任命尚让为平唐大将军，盖洪、费全古为副。贼军皆穿上锦衣，辎重自东都洛阳运抵长安，千里相属。金吾卫大将军张直正与群臣迎击贼军于灞上。黄巢乘黄金舆，警卫人员皆绣袍、华帻，同党乘坐铜舆跟从，骑兵将士数十万浩浩荡荡开赴长安。攻陷京师，进入春明门，升太极殿，宫女数千人迎拜，口称黄王。黄巢大喜曰：“这大概就是天意吧！”
黄巢以宰相田令孜宅第为王府。贼军见穷苦百姓，都拿出金帛给他们。尚让即妄言说：“黄王不会像唐家一样不爱惜尔辈，你们各安生理，不必惶恐。”过去数日，大肆抢掠，绑缚百姓鞭笞居民索取财物，号称“淘物”。富裕人家皆跣足而奔，贼酋看甲第好坏分配居住，奸污百姓妻女，捕得官吏悉斩之，焚毁庐舍不可胜数，宗室侯王屠杀殆尽。黄巢斋太清宫，占卜吉日住进含元殿，僭位称帝，国号大齐。四处寻找皇帝衮冕不可得，用黑色厚重的丝织物绘制相类似图案作为衮冕。没有金石丝竹音乐，用打击大鼓数百面代替，排列长剑大刀为禁卫。大赦天下，建立年号为金统。原来三品以上停职，四品以下原任不动。请风水师算卦，取名广明，判词曰：“唐去丑口而著黄，明黄当代唐。又黄为土，金所生，盖天启”云云。
那些罗罗兵乱哄哄给黄巢起号曰：承天应运启圣睿文宣武皇帝，以原妻曹氏为皇后，以尚让、赵璋、崔璆、杨希古为宰相，郑汉璋御史中丞，李俦、黄谔、尚儒为尚书，方特谏议大夫，皮日休、沈云翔、裴渥翰林学士，孟楷、盖洪尚书左右仆射兼军容使，费传古枢密使，张直方检校左仆射，马祥右散骑常侍，王璠京兆尹，许建、米实、刘瑭、硃温、张全、彭攒、李逵等为诸将军游弈使等等。取五百人号称功臣，以外甥林言为信使，类似于控鹤府。唐僖宗乘銮舆到四川兴元，下诏各地兵马收复京师，并到达成都。
黄巢派遣硃温进攻邓州，陷之，搔扰荆、襄。派遣林言、尚让进攻凤翔，为郑畋部将宋文通所破，不能前进。郑畋传檄召天下兵，泾原节度使程宗楚为诸军行营副都统，前朔方节度使唐弘夫为行营司马。数次攻贼，斩贼万级。弘夫进屯渭北，河中王重荣营沙苑，王处存次渭桥，李孝昌、拓拔思恭坚守武功。弘夫拔咸阳，伐渭水，击破尚让军，乘胜攻入京师。
黄巢偷偷出城，至石井。宗楚从延秋门攻入，弘夫占领城市房屋，首都人一起欢呼说：王师到来了！首都人传言黄巢已逃走，邠、泾军争入京师，诸军掠掠货财子女，地痞流氓乘机作乱。黄巢潜伏野外，派人窥视城中动静，派孟楷率领数百袭击邠、泾军，首都人还以为是王师，列队欢迎。当时军士获得奇珍异宝，无法运走，听说贼军至，负重不能走，所以被击败。贼军抓获弘夫杀害了。黄巢再次进入京师，愤怒市民迎接王师，屠杀八万人，谓之“洗城”。中和二年（882）二月，诸军退保武功。
五月，高浔进攻华州，王重荣合力进攻，克之。硃玫以泾、岐、麟、夏四州兵力八万扎营兴平，黄巢也派遣王璠扎营黑水，硃玫战未能胜。郑畋部将窦玫夜率士兵焚烧都门，杀死巡逻兵，贼军震惧。市民在山谷树栅自保，不能耕种，斗米钱三十千，粉碎树皮为食，有人捉住市民卖给贼军作为口粮，获利数十万钱。
几个月后，贼帅硃温、尚让渡过渭河击败孝昌军。高浔击贼李详，不胜。贼军复取华州，黄巢授华州刺史，任命硃温为同州刺史。贼军又袭孝昌军，二军引退。贼军破陈敬瑄兵，逃往南山。齐克俭扎营兴平，被贼军包围，决河灌之，不克。唐僖宗任命王鐸为诸道行营都统，崔安潜副之。周岌、王重荣为左右司马，诸葛爽、康实为左右先锋，平师儒为后军，时溥督漕赋，王处存、拓拔思恭为京畿都统，处存直左，孝章在北，思恭直右。西门思恭为王鐸军都监，杨复光监行营。中书舍人卢胤征为克复制置副使。于是王鐸以山南、剑南军扎营灵感祠，硃玫以岐、夏军营兴平，重荣、处存扎营渭北，复光以寿、沧、荆南军扎营武功，孝章和拓拔思恭扎营渭桥，程宗楚扎营京右。硃温以兵三千搔掠丹、延南边，直驱同州，刺史米逢出奔，硃温据州以守。
六月，尚让寇河中，派硃温攻西关，败诸葛爽，破重荣数千骑于河上，诸葛爽闭关不出，尚让拔郃阳，攻宜君垒，雨雪盈尺，兵死什三。
七月，贼军进攻凤翔，于涝水击败节度李昌言，惟独凤翔兵固壁。拓拔思恭以锐士万八千赴难，逗留不进。黄河中有粮船三十经过夏阳，硃温派兵夺取船只，重荣以甲士三万救之，硃温恐惧，凿沉其舟，兵遂围温。硃温数度被困，又估计黄巢势即将失败，孟楷正专权，硃温请求援兵，孟楷不报，斩贼军大将马恭，投降重荣。皇帝晋升拓拔思恭为京营四面都统，敕硃玫军驻扎马嵬坡。硃温既降，重荣遇之厚，故李详也跟着纳款投降，贼军发觉，斩之于赤水，任命黄思鄴为刺史。
十月，王鐸浚壕于兴平，左抵马嵬，派部将薛韬负责这项工程，由马嵬、武功进入斜谷，通达盩厔，列屯十四，派部将梁璩率领，设置关卡于沮水、七盘、三溪、木皮岭，以阻击秦、陇之军。
第二年正月，王鐸派雁门关节度使李克用破贼军于渭南，承制拜东北行营都统。正好鐸与安潜皆被罢官，李克用独自引军自岚、石出夏阳，驻屯沙苑，破黄揆军，遂扎营乾坑。
二月，李克用合河中、易定、忠武等兵力进击黄巢。黄巢命王璠、林言军居左，赵璋、尚让军居右，总兵力十万，与王师大战于梁田陂。贼军败，俘掳数万，横尸百里。李克用掘堑环州，分骑兵驻屯渭北，命薛志勤、康君立夜袭京师，俘贼而还。黄巢数战不利，军粮枯竭，士兵不肯打仗，个个都想逃跑，发兵三万扼蓝田道，派尚让增援华州。李克用率领重荣迎战于零口，胜利并拔其城。泾原节度使张钧说服土蕃、吐谷浑与之结盟，共同讨贼。
当时，诸镇兵力纷纷前来增援。四月，李克用派遣部将杨守宗率领白志迁、庞从等作为先锋，进击贼军于渭桥，三战三胜。于是诸节度兵愈战愈勇，唯恐落后，从光泰门进入长安。李克用亲身决战，呼声动天，贼军崩溃，往望春楼逃跑，入升阳殿门。黄巢乘着夜色仓皇逃窜，但是军队仍有十五万，声称赶往徐州，出蓝田，入商山，丢弃辎重珍货于道路两旁，诸军你抢我夺，不再追赶，贼军宵遁。长安城从安禄山打进来，宫阙依然雄伟壮丽。吐蕃所烧，仅仅是街道庐舍。硃泚叛乱平定百余年，修缮神丽如开元时期。黄巢军进入长安，各方镇兵互入虏掠，火烧大内，惟有含元殿独存，只有西内、南内及光启宫没有过火。
杨复光献捷于成都行在，皇帝诏陈许、延州、凤翔、博野军和东西神策二万人驻屯京师，命令大明宫留守王徽守卫诸门。诏尚书右仆射裴璩修复宫省，购辇辂、仗卫、旧章、秘籍。黄巢东去，派孟楷进攻蔡州。节度使秦宗权迎战，大败，投降贼军。孟楷进攻陈州，败死。黄巢抢掠邓、许、孟、洛，东入徐、兗数十州。百姓大饥，靠着墙堑就死了，贼军俘获作为粮食，每天吃掉数千人，于是排列数百巨碓，粉碎人的骨皮于石臼中，一起混杂煮熟吃掉。当时硃全忠为宣武节度使，与周岌、时溥帅师救陈，赵犨乞兵太原。黄巢遣秦宗权进攻许州，未克。于是粮食枯竭，木皮草根皆尽。
中和四年（884）二月，李克用率山西兵由陕西渡过黄河向东追击黄巢军，会合关东诸镇坚守汝州。硃全忠击贼军于瓦子堡，斩万余级，诸军破尚让于太康，斩首万级。黄巢大恐，住了三天，军中屡次夜惊，黄巢退至故阳里。五月，大雨雷电，川溪暴溢，贼垒尽坏，军队溃散，黄巢奔走。硃全忠进戍尉氏，李克用追巢，全忠还汴州。黄巢取尉氏，攻中牟，兵度水半，李克用击之，贼多溺死。黄巢带领残众走封丘，克用追败之，驻扎郑州。
黄巢渡过汴河北去，夜里大雨，贼军惊溃。李克用闻之，急攻巢军。黄巢度河进攻汴州，硃全忠拒守，李克用救之，斩贼骁将李周、杨景彪等。
黄巢夜走胙城，回到老家冤句。李克用率领全军穷追不舍。贼将李谠、杨能、霍存等向硃全忠投降。尚让以万人归时溥。黄巢愈加猜疑部下，屡杀大将，引众奔兗州。李克用追至曹，黄巢兄弟拒战，不胜，逃往兗、郓间，俘获男女牛马万余、乘舆器服等，活捉黄巢爱子。李克用昼夜兼程，因粮尽不能抓获黄巢，乃还。黄巢仅剩千人，逃往保太山。
六月，时溥派遣部将陈景瑜与尚让追战狼虎谷，黄巢大囧，对外甥林言说：“我本来想讨伐奸臣，洗涤朝廷，事成而不知道进退，是人生极大错误。你割取我的首级献给当朝天子，可以获得荣华富贵，不能让其他人得利。”
黄巢说完就出来，让林言杀死自己，林言不忍心杀死自己的舅舅，不肯下手。黄巢就自刎，但是身首没有分离，林言顺势斩断了。并杀死黄巢的哥哥黄存、弟鄴、揆、钦、秉、万通、思厚，并杀死他的妻子儿女，都用木函装起来，准备亲自面见时溥，进献给他。太原博野军杀死林言，把黄巢首级一起献给时溥，时溥敬献于行在，唐僖宗下诏以黄巢首级献于太庙。徐州小史李师悦得黄巢伪符玺，献上，官拜湖州刺史。
黄巢侄子黄浩帅众七千，为盗江湖间，自称“浪荡军”。天复初年，意欲占领湖南，攻陷浏阳，杀略甚众。湘阴邓进思率领壮士埋伏山中，击杀黄浩。
随园少年曰：黄巢从乾符五年（878）起兵到中和四年（884）失败，连头搭尾才七年功夫，可谓流星一现。黄巢的流寇作风对社会造成极大的破坏。皇帝梦连金銮殿都没有焐热，就身首异处。林言意欲以舅舅首级取富贵，无异痴人说梦矣！
