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了解番茄工作法的基础原理之前，我们要了解我们大脑的结构。我们的脑主要是由4部分构成的，即脑干、边缘系统、皮层、额叶，虽然大脑只占我们身体很少的比例，然而却耗能巨大。
脑干主要负责处理规律性事件，打破自身规律的人往往面对迷惘与焦虑。当然也很好解决，即
通过执行一套相同的动作与准备流程，可以使大脑自我调整，进去执行某类事物的最佳状态。
对于番茄工作法的目的就是：
通过“番茄-休息”的不断循环，建立对于这套程序的条件反射
训练自己每当拧起一个番茄钟的时候，自动进去专注的状态。
一种理论认为：持续长时间的专注会导致我们的大脑多巴胺分泌不足，从而增加肾上腺素的生产，这会使我们后继乏力，注意力难以集中，所以我们需要在紧张的工作之余给自己一点休息的时间，采取可持续发展的策略。
另外，频繁的更换所专注的事物，会拉低我们工作的效率，因为我们需要花费更多的时间去调整自己的状态适应新的工作。所以把工作视为一连串的事件逐个击破会大大提高我们的生产力。
对于为什么要中途休息那个几分钟，是因为我们的大脑会在我们清醒但无所事事的时候，给我们提供新的思路和见解，因此短暂的定期休息会促进我们融会贯通的能力。
固定的时间做固定的事会提高我们面对生活压力的能力。
番茄能带给我们的另一项重要的体验就是“心流”，不过这是一种高专注的状态，就是把我们的带宽全部用来处理任务，也可以说是一种“眼光短浅”的状态，但对于我们用来解决任务却是有很大的作用。在休息时我们在放眼全局，统筹规划。
另外这回解决我们的拖延问题，拖延的主要原因就是：
1-别人的强制命令
2-完美主义倾向
3-害怕犯错
番茄在执行途中，所有的任务都是你自己设定的，它只要你开始，就算犯错，也可以在之后的休息时间反思纠正，因此可以大程度上解决人们的拖延问题。
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