文献信息：
标题：Distinct gut metagenomics and metaproteomics signatures in prediabetics and treatment-naïve type 2 diabetics
中文： 2型糖尿病患者首次治疗前后肠道宏基因组学和宏蛋白质组学区别明显
杂志：EBioMedicine
单位：深圳华大生命科学研究院
时间：2019
摘要：
背景:
肠道微生物群在调节宿主代谢中起重要作用。之前的研究已经证明了T2D和前驱糖尿病患者的肠道微生物组与健康人相比存在差异，在不同年龄和种族的人群中报道了不同的与疾病相关的微生物谱。然而，诸如抗糖尿病药物等混杂因素阻碍了对疾病发展过程中肠道微生物变化的识别。
方法:
我们使用的组合深入宏基因组和宏蛋白质组学分析粪便样本首次治疗2型糖尿病(TN-T2D, n = 77),前驱糖尿病(Pre-DM, n = 80)、和正常葡萄糖宽容(NGT, n = 97)个人研究肠道微生物群的组成和功能变化和微生物与宿主蛋白质的粪便内容Pre-DM,首次治疗T2D个人阐明可能描述不同疾病阶段host-microbial相互交错。
研究结果:
我们观察到这三组的肠道菌群存在明显差异，并在一个独立的TN-T2D队列中验证了几个关键特征。我们还证明了三组粪便样品中几种人抗菌肽和胰腺酶的含量不同。
解读:
我们的发现表明肠道菌群和宿主之间存在一种复杂的、疾病阶段依赖的相互作用，并指出了宏蛋白质组学对进一步了解肠道菌群和宿主之间的相互作用的价值。
实验设计：
1 MLG和功能丰度的改变
2 肠道微生物组特征在宏基因组和宏蛋白质组中的一致性和不一致性
3 中国NGT、Pre-DM和TN-T2D个体粪便样本中的人类蛋白特征
