第一种,在EBI 查找,
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home 常规转录组可能直接找到下载R1,R2
第二种,从NCBI的ftp服务器直接下载,
ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/srr/ 如果下载SRR数据,可以在这里获取直接连接,根据SRR号的前三位,后三位/后两位定位数据。速度还行,多线程速度感人。
第三种,从对应样本的目录下直接下载
第一种,在EBI 查找,
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home 常规转录组可能直接找到下载R1,R2
第二种,从NCBI的ftp服务器直接下载,
ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/srr/ 如果下载SRR数据,可以在这里获取直接连接,根据SRR号的前三位,后三位/后两位定位数据。速度还行,多线程速度感人。
第三种,从对应样本的目录下直接下载