下载Conda
- 谷歌搜索：miniconda 清华，进入https://mirror.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/
- 找到Miniconda，进入https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
- 查看服务器是多少位的：输入命令
uname -a - 网页往下拉，安装对应位数的最新版本（latest）
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右键-复制链接地址
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连接Linux，新建biosoft目录，并进入
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wget 复制的链接
安装Conda
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh-
source ~/.bashrc：激活conda
添加镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
使用Conda
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conda list：查看当前所有软件列表 -
conda search 软件名：如conda search fastqc（搜索数据质控软件fastqc） - 安装软件
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conda install 软件名 -y-y 表示自动安装 - 指定版本号：
conda install 软件名=版本号 -y
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conda remove 软件名 -y：卸载软件
Conda环境配置
不同项目需要用到同一软件的不同版本时，需要建立多个Conda环境，使软件互不干扰
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conda info --envs：查看当前conda有哪些环境 - 建立名叫rnaseq的conda环境，指定python版本3，安装软件fastqc、trimmomatic：
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y - 激活新环境
conda activate rna-seq
Day2的拓展问题
ls输出的是横向的列表，怎样输出长格式列表
-1：输出长格式列表
如何查看长格式列表中文件的大小？
-l：以长格式显示目录下的内容列表。输出的信息从左到右依次包括文件名，文件类型、权限模式、硬连接数、所有者、组、文件大小和文件的最后修改时间等
查看Linux系统版本、内存与硬盘空间？（提示：分别是三个命令）
- 系统版本：
lsb_release -a - 内存：
free -m - 硬盘空间：
df -h
怎样建立类似/tmp/tmp1/tmp1.1 这样的层级目录（提示：搜索mkdir）
mkdir -p ~/tmp/tmp1/tmp1.1
怎样删除这些层级目录（提示：搜索rm）
rm -r tmp
-r或-R：递归处理，将指定目录下的所有文件与子目录一并处理
