DNA芯片技术、基因芯片、蛋白质芯片的制作方法、原理和检测方法。
生物芯片技术都包含四个基本要点:芯片的制作、杂交或反应、测定或扫描、数据处理。
具体而言,比较典型的DNA芯片制备方法有4种:
第一种方法是Affymetrix公司开发的光引导原位合成法,该方法是微加工技术中光刻工艺与光化学合成法相结合的产物。
第二种方法是Incyte Pharmaceutical公司采用的化学喷射法,该方法是将合成好的核昔酸探针定点喷射到芯片上并加以固定化来制作DNA芯片。
第三种方法是斯坦福大学研制的接触式点涂法。在DNA芯片制备中通过高速精密机械手的精确移动让移液头与玻璃芯片接触,而将DNA探针涂敷在芯片上。
第四种方法是通过使用4支分别装有A,T,G,C核苷的压电喷头在芯片上并行地合成出DNA探针。根据芯片上的固定的探针不同,生物芯片包括基因芯片、蛋白质芯片、cDNA芯片,目前制备芯片的方法基本上可分为两大类:一类是原位合成(in situ Synthesis);一类是合成后交联(post-synthesis attachment)。它包括化学喷射法、接触式点涂法。合成点样法虽然芯片上探针的密度相对较低,每个样品都要预合成、纯化,在芯片制备前还需妥善保存合成的探针,但是它的最大优点是操作简便。其中,接触式点涂法的优点是探针密度比较高,缺点是定量准确性及重现性不好,打印针易堵塞且使用寿命有限。喷印法的优点是定量准确,重现性好,使用寿命长;缺点是喷印的斑点大,因此探针密度低,通常只有1平方厘米400点。
其基本原理和检测方法如下:
采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体)的表面,组成密集二维分子排列,然后与已标记(荧光、地高辛、生物素)的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描或电荷偶联摄影像机(CCD)对杂交信号的强度进行快速、并行、高效地检测分析。
基本原理:DNA与DNA,蛋白质与蛋白质,DNA与蛋白质之间的相互作用。