2017年6月，由北京邦菲生物科技有限公司（简称“邦菲生物”）、北京聚道科技有限公司（GeneDock）、中科院计算所pFind团队联合研发的“邦菲云”在线分析平台正式投入使用。
“邦菲云” 是国内首家蛋白质组学在线分析平台。 “邦菲云”在线分析平台经过大量项目检验和测试，运行稳定可靠，用户可根据自己的需求设置流程参数，基本分析参数设置透明化。平台支持多样化的分析类型，满足文章撰写、生物学问题解释等各种需求。
“邦菲云”在线分析平台特点：
国内首个具有自主知识产权的蛋白质定性定量分析平台
“邦菲云”整合了中科院计算所pFind团队研发的具有自主知识产权的蛋白质定性定量分析平台pFind Studio，支持来自Thermo，AB Sciex等不同厂商的质谱原始数据格式，一键式完成蛋白组数据定性和定量分析。和传统搜库软件相比较，pFind软件搜索速度更快，鉴定蛋白数更多。
可视化界面，生信零基础操作
“邦菲云”在线分析平台平台基于SaaS模式架构，支持Web端图形化操作方式，通过提供高性能的标准化蛋白质组学分析流程，生信零基础人员亦可便捷地进行蛋白质组学分析工作，让数据分析脱离“专业高门槛”，更加“大众化”；用户可以更加专注于深入解读数据，快速获得目标信息；
目前“邦菲云”已经搭建了数十个工作流，用户除了可以完成常规的差异表达蛋白筛选，聚类分析、功能注释、GO富集分析、KEGG富集以外，我们提供了针对iTRAQ和LabelFree数据的一键式打包分析工作流，客户可以将传统的数据分析流程从原来几天压缩到现在的30 分钟。
“多快好省”
基于云计算场景，“邦菲云”对分析流程和计算资源调度进行了大量优化和改进。利用GeneDock提供的生信云基础架构，“邦菲云” 上的蛋白组数据标准化分析服务达到了行业领先水平，可以低成本高效率地完成大批量蛋白组数据的标准分析。
“邦菲云”运用了先进的分布式计算技术，并且针对蛋白组分析流程进行了算法级优化，使得LabelFree样品从搜库到后续功能分析注释全过程在1小时内即可完成。借助GeneDock提供的生信云计算资源，用户可以同时在“邦菲云”平台上对100个样本同时进行分析处理，且仅需承担实际资源耗费成本，而无需再投入硬件和运维资源。
目前，“邦菲云”平台可以支持约100个样本数据的并行处理，并可在1个小时内完成一个LabelFree样品从搜库到后续功能分析注释全过程。
邦菲生物、GeneDock和pFind团队在“邦菲云”在线分析平台上的合作，是一次史无前例的革命性探索！“邦菲云”的诞生更是蛋白质组学行业的一次里程碑式的创新！以往从没有任何一家分析平台是专门针对蛋白质组学的，“邦菲云”就是为蛋白质组学量身定做的分析平台，让从事蛋白质组学研究的工作者找到了“家”，也为想了解但又被“专业门槛“拒之门外的研究人员打开了一扇窗！
关于邦菲生物
邦菲生物科技有限公司成立于2013年，是一家专业从事蛋白质组学服务的公司。邦菲生物有自己的研发团队和数据分析中心，在生命科学、农林、水产和医学研究领域对于蛋白质组学有着丰富的经验和积累。同时其核心团队成员全部来源于 Thermo 定制服务部，在技术服务领域有着十余年专业经验和成熟的运作模式。
关于GeneDock
GeneDock成立于2014年，致力于用组学数据技术，为合作伙伴提供临床智能决策支持、多中心临床实验、组学科研协作、工业生信计算生产等场景的技术方案，支持科研单位、企业、医院等提高组学数据管理应用效率，挖掘组学数据价值。通过满足不同场景的实际应用需求，GeneDock累积了丰富的组学数据应用管理经验，已支持包括三甲医院、科研院所、国家疾控中心、基因检测公司在内的合作伙伴们建设具备组学数据集成、流程协作、机器学习等能力的系统和平台。
关于pFind
pFind团队自2002年成立以来，在计算蛋白质组学领域持续探索，发展了一系列海量生物质谱数据分析算法，并在此基础上提出了国内首个具有自主知识产权的蛋白质定性定量分析平台pFind Studio。目前，pFind系列软件已在国内外下载超过2,000套，遍布世界30余个国家和地区，并实际支持了166项生物质谱相关研究。
