课程四：R语言基础
R语言啦，感觉自己又要进步了～～～
思维导图：
老师言：
要学R语言了，R和Rstudio下载到自己电脑上。R需要的操作全部在自己电脑上，因此不涉及到服务器。（服务器可以配置自己的Rstudio，供大家远程登陆，用浏览器打开后面加上：8787就可以登录，但是阿里云并没有自带，用自己电脑完全可以的。）
如果你的电脑用户名是中文的，需要多一个流程，这是因为中文路径会给你带来麻烦。
来源：https://m.umu.cn/session/article/2jzz6c61c
学习内容：
- 安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面）
- 粗略了解R语言是什么，干什么的，认识Rstudio的工作界面
- 学会外观设置和基本操作
- 完成第一个R做的图
准备工作
第一步：查看你的电脑用户名是中文还是英文
第二步：预防中文用户名引起的报麻烦
花花的碎碎念---如果你安装完成，要知道自己已经迈过了好大好大的一个坑！！一般来说你并不知道Rstudio需要英文用户名，如果你自己发现了，那一般是在安装上碰了壁，浪费了好长时间然后想明白，再去找教程改用户名，就不是一两小时能完成的事情了。网上有很多改用户名的教程都不好用，你甚至看不懂他在说什么。好的下载教程也不是随手能找到的，教大家的搜索方法要学以致用，善假于物，站在前人的肩膀上飞的更高。
以下1- 2的 内容来自：果子学生信 给自己一个全新的R语言环境
1. 下载R和Rstudio
1.1 下载R语言
网址： https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/
1.2 安装R语言
然后就是下载后无脑安装。可以选择一个大一点的盘，也可以不用管。
2. 下载Rstudio
2.1 下载Rstudio
网址：https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
2.2 安装Rstudio
无脑安装
2.3 分别设置pakage和外观
pakage的地方选择清华镜像源啊，外观根据自己的需要。
2. 认识R和Rstudio
- R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。
- R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。
- RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。
2.1 用Rstudio练习作图
必应查查plot和runif什么意思
2.1.1 练习一：plot
- 命令：
plot(rnorm(50))
-
结果：
image.png 分析：
2.1.2 练习二：boxplot
- 命令：
boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))
-
结果：
image.png 分析
- iris是一个R语言自带的数据框，通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。以此类推。
- 作图说简单也简单，只需要知道图的名字，知道用的什么R包即可自行探索；说难也难，别人的代码套在自己的数据上，需要一定的R语言功底和解决报错的能力。
3. R语言基本操作
3.1 用R-project管理工作目录
所谓工作目录就是默认的读取和储存位置，也就是说，R语言只能和一个文件夹进行互动，这个文件夹非常重要，做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑，找不到。
查看这一篇，养成好习惯：
https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA
以下3.1的所有内容，均来自：R-project管理多个R工作目录
正常情况下关于工作目录的介绍是：
- 设置工作目录：setwd()
- 查看工作目录：getwd()
- 这样的话，只设置了一个工作目录。
当你有多个项目并行的话，全都在一个文件夹下，会显得比较乱，“你就会很lao火”。下面介绍如何并行多个项目，也就是多个工作目录。
3.1.1 新建project
3.1.2 打开R-project
生信技能树创始人jimmy推荐，只用这一个方法打开Rstudio。那么下次再要打开这个项目时，只需要在文件夹中找到这个R project，双击打开即可。
3.2 显示文件列表
补充：Mac新建txt文档
- 打开Finder---点击“应用程序”－－找到“文本编辑器”。
- 点击打开文本编辑器，在弹出窗口中选择“新建文稿”。
- 点击顶部菜单栏中的“格式”，选择“制作纯文本”。
- 编辑文本内容。
- 保存txt文件，点击顶部菜单“文件”，选择“存储”，然后按图选择编码格式和设置文件名称，点击“存储”以保存。
直接打命令不跟路径会显示哪里？显示默认路径，也就是工作目录。
相当于linux的ls。
dir()
3.3 加减乘除
命令+回车
3.4 赋值
- 赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号
x<- 1+3 意思是把1+3的运算结果赋值给x， 赋值后，x会显示在右上角的框，Environment里的Value列表里。- 直接输入x 回车，就会把x的值（4）打印到控制台上,前面的那个[1]是结果的第一个，不用管他。
3.5 删除变量
a<-3
b <- 1
c <- 4
u <- 5+6
rm(b)
rm(u,c)
rm(list = ls())#清空所有变量
ls（）
## Error: unexpected input in "ls?
括号是中文，会报错。
3.6 列出历史命令
history()
相当于鼠标单击右上角的history标签
当你双击某个命令，他就会跳到你的控制台大于号后面了，可以修改后运行。
3.7 清空控制台
快捷键"ctrl+l"
本笔记内容基于生信星球学习小组第68期
感谢老师们的辛苦指导！！
