距今几十万年的时候，出现了一个迄今为止最早有史书记载的发明家、建筑家——有巢氏。
他带领他的族群走出了他的祖先们居住了几十万年的洞穴，模仿鸟类在树上建造了可以抵抗躲避野兽天敌的巢穴，因为这一举动，他受到了当时他的原始人同伴们的拥戴，成为了有史料记载以来第一任人类族群的头领，被后世称为“巢皇”，据说还建立了一个蒙昧的国家，后世称为“有巢国”。
《庄子·盗跖》曰：“且吾闻之，古者禽兽多而人少，于是民皆巢居以避之。昼拾橡栗，暮栖木上，故命之曰有巢氏之民。”
《韩非子·五蠹》载：“上古之世，人民少而禽兽众，人民不胜禽兽虫蛇。有圣人作，构木为巢以避群害，而民悦之，使王天下，号曰有巢氏。”
在当时那么一个茹毛饮血的石器时代，人类连火都没有开始使用，为什么会出现一个被大量史书记载的“有巢国”呢？为什么我们的原始人祖先，会纷纷集中在“有巢国”安家立业呢？让我们来站在迄今为止能查阅到的历史资料的作者们的肩膀上，来大胆的猜测一下上古时期，这个王国是怎么发源、兴盛的……
首先，我们从这个王国的起源地入手，这个王国发源与哪里呢？按照现在主流的说法，这个国度发源于现在的安徽巢湖，并沿着巢湖和长江往东北方向延伸，直到南京江北地区一代的方圆几千米的水泽、山林地区。这么广阔的范围，为什么会出现一个流传千年的“有巢国”呢？
有巢氏的发源，肯定是从有巢氏建造的第一个“巢”开始辐射、蔓延的，那么有巢氏的部落作为第一个修建巢穴的部落，他们会选择在什么地方修建巢穴呢？我觉得，他们会选择在水源的最大的树林里修建，因为从零开始摸索修建巢穴是一个工作量巨大的工作，那么他们就没有时间去狩猎了，所以他们要选择一个靠近水源的地方，因为靠近水源，就可以在水里捉鱼，他们只需要一部分研究他们的树屋，一部分人下水捉鱼就可以在维持部落生存的同时，最高效率的去完成他们建立巢穴的大工程了。至于为什么选择在最大的树林里，因为在他们没有建好树屋的时候，晚上在树上就可以躲避他们的大部分天敌了。所以在有巢氏修建好第一个巢穴之前，他的部落是在大树上或者树洞里休息的。那什么样的地方有大树呢？越大的树林里树就越大。这样看来，有巢国的发源地，就是在当时的巢湖岸边，一个不知名的树林里。
有了巢穴以后有巢氏的部落发展就很快了，因为他们聚集在靠近水源的地方，又拥有相对别的穴居部落更为安全，更为先进的巢穴建造技术，他们就拥有更为安逸的发展条件，越来越多的部落看到后学习他们沿着巢湖岸边安营扎寨，随着这些部落之间的交流、融合，就形成了今天我们眼中的这个当年最大的原始部落——有巢国。当时有巢氏作为这个在当地发展了最久的最强大部落的首领，自然就是这个“有巢国”的“巢皇”。
禹帝时曾封有巢氏之后建立巢国，巢国正式成为历史上的诸侯国之一，夏朝被商汤灭亡的时候，巢国还收留了夏朝的亡国之君夏桀并且成为了商朝的诸侯国。
《尚书·仲虺之诰》记：“成汤放桀于南巢。”
《吕氏春秋》记：“汤伐桀，战于成，登自鸣条，乃入巢门。”
周灭商之后，巢国被周朝打败，因为巢国地大势强不便控制，遂将其地析分为巢、庐（庐，房屋，与巢同义）二国，因赐爵位不同，而分别被称为“巢伯国”、“庐子国”，庐国新都于今合肥城城区，巢国仍都于今巢城城区。直到春秋时期，古巢国作为楚吴的交战战场，时而被吴国抢走，时而被楚国抢走，直到公元前518年，传承了几十万年的古巢国才彻底被吴国灭亡。
《左传·昭公二十四年》云：“吴人踵楚，而边人不备，遂灭巢及钟离而还。”
