琼脂糖是由琼脂中提取出来的D-半乳糖和3、6-脱水-L-半乳糖结合的链状多糖。
琼脂糖电泳具有以下优点：
①琼脂糖含液体量大，可达98%~99%,近似自由电泳，但样品的扩 散度比自由电泳小，对蛋白质的吸附极微；
②琼脂糖作为支持体具有分布均匀、区带整齐、分辨 率高、重复性好的优点；
③电泳速度快；
④透明而不吸收紫外线，可以直接用紫外检测仪作定 量测定；
⑤区带可染色，样品易回收，易于制备。
琼脂糖凝胶电泳常用缓冲液有TBE、TAE两种， pH在6~9之间，核酸在pH 6~9的缓冲液中带负电荷，在电场中向正极移动。琼脂糖凝胶具有多 孔的网状结构，以其为介质电泳时，不同大小的核酸可借凝胶的分子筛作用而得以分开。用溴化乙啶染色后，在紫外灯下，可见染成橘红色的核酸条带。
