搭建一套云工作平台 (JupyterHub + Rstudio Server)

为什么会做这个 ?

使用 Chromebook 的朋友都知道,电脑上是没有也是不太可能在上面跑程序的(crouton 装 Linux 也是可以的,但是,本身存储空间不多,而且性能也是不够的呀),所以打算在云上搭好一个工作环境,这样带着 Chromebook 也可以完成作业。

搭建一套云工作平台要几个步骤:

  1. 有云
  2. 装系统
  3. 使用

PS:此系统仅使用于我自己的需求,如果有更多需求的朋友可以自己摸索

拿到一台服务器

Google Cloud 的 300 刀,是个好选择。当然,如果你想要速度快的,可以选择国内的云服务商,学生优惠力度还是很大的,平均也是两三百一年的价格。

要在服务器上做什么?

我的需求: R Python MATLAB

需求很简单,因为没想着要拿这台东西做什么大新闻。一开始,我选择的是 AWS 的 cloud 9 系统(现在放弃了),如何安装 cloud 9 这里就不详细介绍了,可以看这个 URL: <a href="https://www.seulinux.online/2017/08/24/使用Docker和Cloud9搭建Web端IDE/"> 使用Docker和Cloud9搭建Web端IDE </a>

现在的搭配:Rstudio Server + Jupyter Hub:

  1. 为什么选择 Rstudio Server 呢?
    Rstudio 在我看来是 R 最好的 IDE了,既然他有 Server 版,而且提供 GUI 界面,为什么不是用它呢?

  2. 为什么是用 Jupyter Hub 呢?
    有多人使用的需求,而且,玩嘛,不行就重装(逃

综上:这一套有什么好处(优势)呢?

  • 确实比 cloud 9 好用,cloud 9 就像是一个啥都会一点,但是啥都不做不好的小朋友,发展的还不够成熟,而且相应速度慢;
  • 使用 Rstudio Server 可以统一管理、安装、配置 R packages,舒服
  • 我有多人使用的需求,cloud 9 不给钱不能多人,这一套可以。
  • Jupyter 支持这么多 kernel ,为啥不用!

目前服务器的系统环境如下:

No LSB modules are available.
Distributor ID: Debian
Description:    Debian GNU/Linux 9.5 (stretch)
Release:    9.5
Codename:   stretch

安装 Rstudio Server

Rstudio 的官网上有完备的安装方法:<a href="https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/"> Download RStudio Server </a>

  1. 如果你的系统也是 debian 系:
    首先你需要在服务器上安装 R:
    sudo apt-get install r-base

  2. 如果你的系统是 Debian 8 / Ubuntu:

    要下载和安装RStudio Server,请打开终端窗口并执行以下命令(相应于32位或64位版本)。注意,首先安装了gdebi-core包,这样gdebi就可以用来安装RStudio及其所有依赖项:

64bit
Size: 60.6 MB MD5: ea77929e40eac30baee9e336e26a1dd5 Version: 1.1.456 Released: 2018-07-19

sudo apt-get install gdebi-core
wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-1.1.456-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-server-1.1.456-amd64.deb

32bit
Size: 51.8 MB MD5: f3e2e67cdb0ec84fd62076f5d0f7539c Version: 1.1.456 Released: 2018-07-19

sudo apt-get install gdebi-core
wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-1.1.456-i386.deb
sudo gdebi rstudio-server-1.1.456-i386.deb
  1. 如果你的系统是 Debian 9+:

    要下载和安装RStudio服务器,请打开终端窗口并执行以下命令:

64bit
Size: 38.8 MB MD5: 5ce46eeafd40bd4e2db65841f3ab5759 Version: 1.1.456 Released: 2018-07-19

sudo apt-get install gdebi-core
wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-stretch-1.1.456-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-server-stretch-1.1.456-amd64.deb

然后,你就可以去试下访问:http://<IP-addr>:8787 了,要注意这么几个点:

  • Rstudio Server 不能用系统账号访问
  • 每个用户的文件都是在 /user/home

如果你有更加个性化的配置和管理:请参照 Rstudio 的官网文档(真的良心好吧,写的很详细):

  • <a href="https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552316-Configuring-the-Server"> Configuring the Server </a>
  • <a href="https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200532327-Managing-the-Server"> Managing the Server </a>
  • <a href="https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552326-Running-with-a-Proxy"> Running with a Proxy </a>

安装 Jupyterhub

这个就更是 easy 了, conda 的话一行命令解决的问题。当然,我是用 pip 的......

首先, 你需要 npm,对于 Debian 9 是这样操作的:

sudo apt update
sudo apt install nodejs

然后,check 一下 装进去了没有(版本号):nodejs -V

事实证明,我按这个方法装是装不进去的(可能是 apt 出问题了,没深究),然后,我就用 PPA 装了(Personal Package Archive):

sudo apt update
sudo apt install curl
cd ~
curl -sL https://deb.nodesource.com/setup_10.x -o nodesource_setup.sh
nano nodesource_setup.sh
sudo bash nodesource_setup.sh
sudo apt install nodejs

然后,再 check 一下:

nodejs -V
npm -V

而后,开始按照<a href="https://github.com/jupyterhub/jupyterhub"> 教程 </a> 安装 Jupyterhub:

npm install -g configurable-http-proxy
python3 -m pip install jupyterhub    
python3 -m pip install --upgrade notebook

如果你机器上没有 python3 / pip3,请自行解决(Don't ask me, ask your computer)

Jupyterhub / Jupyter-notebook 默认都是不能用 root 账号登录的,当然,我们可以 --allow-root,但是,新建一个账号也不难(记得给 sudo 权限,不然,你要安装各种包的时候会很痛苦)

另外,默认是本机IP 才能登陆,我们需要在 config 文件下修改一下:

  1. 生成 configjupyterhub --generate-config
  2. 进入 config,找到 c.JupyterHub.ip 修改为:‘0.0.0.0' 即可在外网访问

其他问题按照教程指示:<a href="https://github.com/jupyterhub/jupyterhub"> 教程 </a> 按需索取。

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