编译安装BLAS和LAPACK

之前在帮一位校友安装NumPy和SciPy的时候遇到不少问题。这两个Python包都依赖Fortran库BLAS和LAPACK. 这位校友在实验室机器上的用户没有sudo权限,所以无法通过系统的包管理器来安装依赖库,只好逐个编译安装。经过苦苦寻觅,终于在Stack Overflow找到了编译安装的方法。现把安装过程在CentOS 6.4上重现一遍。

先在用户主目录下面创建src目录,然后切换到src目录下操作。

mkdir ~/src
cd ~/src

安装BLAS

1、准备源码

wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz
tar zxf blas.tgz
cd BLAS-3.5.0/

2、编译

如果是32位系统,使用GNU的g77或gfortran编译器来编译:

g77 -O2 -fno-second-underscore -c *.f
gfortran -O2 -std=legacy -fno-second-underscore -c *.f

如果是64位系统,使用GNU的g77或gfortran编译器来编译:

g77 -O3 -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f
gfortran -O3 -std=legacy -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f

如果使用的是Intel的Fortran编译器,则:

ifort -FI -w90 -w95 -cm -O3 -unroll -c *.f

注意:

  • 请根据情况选择上述5个命令中的一个执行
  • 在编译BLAS、LAPACK、NumPy和SciPy的时候,所选择的Fortran编译器必须要保持一致
  • 在下述LAPACK的编译安装中,需要使用Fortran 90编译器,因此不应该使用g77来编译BLAS

3、后续工作

ar r libfblas.a *.o
ranlib libfblas.a
rm -rf *.o      # 清理文件
export BLAS=~/src/BLAS-3.5.0/libfblas.a # 导出BLAS环境变量

安装LAPACK

1、准备源码

wget http://www.netlib.org/lapack/lapack.tgz
tar zxf lapack.tgz
cd lapack-3.6.0/

2、编译

cp INSTALL/make.inc.gfortran make.inc   # On Linux with lapack-3.2.1 or newer
make lapacklib

注意:在执行make lapacklib之前,编辑make.inc文件,给OPTSNOOPT这两个设置都加上-fPIC选项。如果是64位系统,还需要加上-m64选项。修改后,看起来像这样:

FORTRAN  = gfortran 
OPTS     = -O2 -frecursive -fPIC -m64
DRVOPTS  = $(OPTS)
NOOPT    = -O0 -frecursive -fPIC -m64
LOADER   = gfortran

3、后续工作

make clean      # 清理文件
export LAPACK=~/src/lapack-3.6.0/   # 导出LAPACK环境变量

参考资料

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 202,905评论 5 476
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 85,140评论 2 379
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 149,791评论 0 335
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,483评论 1 273
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,476评论 5 364
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,516评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,905评论 3 395
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,560评论 0 256
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,778评论 1 296
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,557评论 2 319
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,635评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,338评论 4 318
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,925评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,898评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,142评论 1 259
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 42,818评论 2 349
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,347评论 2 342

推荐阅读更多精彩内容