导--细胞遗传学正常的中国急性髓系白血病患者的突变谱及相关临床特征

来自医学基因组学国家重点实验室、上海血液学研究所副研究员陈冰于2018年发表在International Journal of Laboratory Hematology的文章Mutation profile and associated clinical features in Chinese patients with cytogenetically normal acute myeloid leukemia


摘要

导言:细胞遗传学正常的急性髓系白血病(CN-AML)占AML患者总数的近一半,是AML的高度异质性子集。CN-AML的具体遗传特征和种族特征值得研究。
方法:采用深度测序技术检测152例中国CN-AML患者39个基因的突变模式,并分析其临床特征。
结果:145例(95.4%)患者共检测到39个基因的503个突变,平均每个病例3个突变。9个基因(NPM1、CEBPA、DNMT3A、GATA2、NRAS、TET2、FLT3、IDH2和WT1)在超过10%的患者中发生突变。髓系转录因子、激活信号和DNA甲基化的功能组受影响最大。复发基因的变异等位基因频率(VAF)在不同功能组中的分布不同。CEBPA和GATA2的高突变率以及FLT3-ITD的低突变率似乎是中国患者的显著特征。此外,发现CEBPAbi和GATA2在M2亚型中突变最多,而NPM1和DNMT3A在M4和M5中突变更多。预后分析确定CEBPAmo突变为次要因素。选择FLT3-ITD、TP53、DNMT3A、CEBPAmo和WT1突变作为高危标记物,以识别预后不良的CN-AML患者。
结论:本研究为中国CN-AML患者的民族遗传特征和临床相关性提供了有价值的信息。


介绍

急性髓系白血病(AML)是一种临床和生物学上的异质性疾病。数十年的细胞遗传学和分子研究揭示了发病机制的基因异常,并产生了分子诊断和预后评估系统,特别是在应用下一代测序(NGS)技术之后。由于癌症基因组图谱(TCGA)小组已通过全基因组(WGS)或全外显子组测序(WES)在200例AML患者中识别出23个显著突变的基因,在几个大型AML队列中研究了突变模式和相对预后评估,进一步提高了诊断的准确性。

突变模式在不同人群中呈现一定的异质性。例如,TP53突变与复杂的核型和不良预后高度相关,10例继发性AML显示更多ASXL1突变和IDH2、TET2和DNMT3A突变的发生率随年龄增加而增加。值得注意的是,由于观察到正常核型(细胞遗传学正常AML,CN-AML)患者中NPM1和DNMT3A等几个驱动基因的突变频率更高,因此CN-AML中的突变分布可能是特殊的。

对于预后预测,欧洲白血病网络(ELN)和国家综合癌症网络(NCCN)等公认的国际风险分层系统更依赖细胞遗传学异常,以及NPM1、CEBPAbi、FLT3-ITD和TP53突变来区分一些低风险或高风险患者。在ELN和NCCN风险分类中,约50%核型正常(CN-AML)的AML患者被分为中等风险组,这实际上包括缺乏精确预后指导的高度异质性患者。因此,CN-AML的突变模式以及精细的临床和预后相关性需要阐明。

此外,血液系统恶性肿瘤中分子标记分布的种族差异;例如,与西方人群相比,中国B细胞急性淋巴细胞白血病患者的t(9;22)/BCR-ABL1的频率更高,t(12;21)/ETV6-RUNX1的频率更低,亚洲慢性淋巴细胞白血病患者的3q和18q gain更为常见。CN-AML突变谱的种族差异也值得研究。

利用target深度测序策略,我们在这里报道了对152例中国CN-AML患者基因突变的综合研究,旨在深入了解独特的基因图谱和更好的风险咨询,并为临床实践提供有价值的信息。


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