写在前面
约莫一个月前，不知为何，突然收到好几个朋友问了一些TBtools的使用问题。按照我个人的设想，TBtools的使用应该不会存在使用问题。从开放使用至今，几乎没有停止过接受用户的反馈和改进。感谢TBtools的用户群体，大家一起让TBtools成为更实用的生信下游数据分析外挂小工具。
然而，无论是我们人再多，发现的问题还是有限。而每个人的软件使用习惯也有所不同，对于刚接触生信流程化分析结果的朋友，尤其是湿实验室的朋友，往往会不知所措，更或者耗费大量宝贵的时间在重复一些诸如
- 序列提取
- 韦恩图绘制
- 热图绘制
- GO富集分析/KEGG 通路富集分析
等繁杂而简单的事情上。而这些分析目前均在TBtools上有一定程度的实现，因为他们的原理极其简单，但是操作却非常耗时。使用TBtools，用户完全可以在极其短的时间内掌握并使用。
而如何让用户尽可能短的时间内，掌握TBtools的使用？是一直困扰我的问题，所以也有了前面开设的课程，见TBtools正式开课的推文，目前已征得已报名的朋友的统一，再招50人。
我们已经开展了一次热身课程和两次课程（均有录屏），接下来是要讲到GO和KEGG注释与富集分析。
而富集结果的可视化，终于在TBtools新的绘图引擎更新（得益于课题组所需浏览器的开发）之后，可以非常方便的实现。故，我花了几个小时的时间完成了其功能实现和GUI的接口开放。
GO 和 KEGG 的 富集分析
其实最普遍的操作，只是一个超几何分布的检验，更或者说，使用Fisher's Exact。TBtools很早就支持GO 和 KEGG的富集分析，以下仅展示使用的文件，而不会涉及这些文件的获取（因为往往现在大多数公司均提供非常廉价的分析服务，结题报告中有这些信息）。
GO 富集分析
需要准备三个文件
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GO的层级结构文件，即go-basic.obo，可直接从网站上下载，点击摁钮即可跳转
obo文件下载 -
GO注释的背景信息，query2Go.backGround，这个文件一般需要先通过GO注释获得，或者直接从公司的结题报告中整理获得，大体格式如下
GO注释背景示例图 -
选择集，如差异表达基因的ID列表，或者通过韦恩图分析获得的ID列表，如
选择集列表
准备好文件之后，直接使用TBtools即可，点击Start摁钮，等到完成富集分析
富集分析结构信息比较多，如果没有接触过的朋友，可直接只查看.final.xls文件
完成了富集分析，那么我们就可以对富集分析结果进行可视化
非常快，在点击Start之后，就会弹出
这个对话框中，几乎所有元件都可以按照分组统一调整，包括字体，大小，颜色等...随后可以保存为SVG或者PDF等矢量图
KEGG富集分析...
已经过了14点30分了，差不多要去果园采荔枝了估计，就先不写了。
写在后面
最近我报名了8月份在成都的全国植物基因组学会议，由于学校报账制度的问题，似乎无法请款用于参会。故，
欢迎各位朋友打赏，多多益善
