发简信
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基因家族扩张收缩分析- OrthoFinder聚类基因家族1. Summary 基因家族扩张收缩分析可细分为六部分： 获取每个基因对应的最长编码区转录本 OrthoFinder聚类基因家族 系统发育树推...
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基因家族扩张收缩分析-提取基因对应的最长转录本
写在前面：根据“白烟囱假说”，一切的一切都从深海热液开始。从最初的单细胞生物到如今繁杂的世界，为了适应不断变化的外界环境，生物体需要不断且缓慢地...
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基因家族扩张收缩分析-cafe结果可视化-cafe4cafe自带的程序，只能单独标注扩增或者收缩的基因家族数。手工标注又很麻烦，所以我写了一个R程序，虽然图不够精致，不过基本解决问题。 cafe_...
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预测变异的效果基因组上有很多变异，不同变异的效果不同。除了wet-lab，现在也有很多软件预测。接下来，我打算用SIFT4G、Polyphen-2、SnpEf...
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ANI随着全基因组测序成本的不断下降，细菌分类相关方法也从DNA-DNA hybridization（DDH）这类实验性方法转移到基于基因组序列的相似...
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multiple whole genome alignment写在前面：在上亿年的进化历程中，基因组经历了大大小小的改变。从小的核苷酸突变、插入、缺失到大的基因缺失、重复、基因组重排和水平基因转移。基因组比...
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pdf转换1. 自己的pdf放入PPT 为了更好地展示工作，我们常常需要将pdf放入ppt。不同展示的需求不同，我们需要去掉其中的文字，重新添加。 如果直...
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tmux-os
参考链接：https://www.jianshu.com/p/fd3bbdba9dc9 1. prefix 2. 配置文件 2.1. 内容 2....
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构建ncbi——nr本地库网上方案都是用ncbi-blast+程序包的updata_blastdb.pl自动下载，然而我下了两天，一直断···被逼无奈下，我只能用wget...