本人目前从事生信分析相关领域， 记录一些常见的坑，也希望能帮助到类似经历的人。
发简信
IP属地：湖南
-
-
我想问有一下TCR分析需要分开链吗 可以四条链混着做吗
全网最全免疫组库分析流程+代码复现（二）
代码复现： 1.结果转换（使用TRUST4恢复） 因为TURST4恢复的结果不能直接适配vdjtools，所以需要进行列名更改。示例：样品分为Control和Treatmen...
-
个人主页：hbox.cool
-
"将log化后的负无穷值替换为0" 这不对吧 相当于改变原本的表达丰度了 原始表达值是0 log2之后为-inf 比其他表达值都小 你一换成0 不就直接把值改大了吗
转录组丨limma差异表达分析，绘制火山图和热图
limma差异表达分析 本篇笔记的内容是在R语言中利用limma包进行差异表达分析，主要针对转录组测序得到的基因表达数据进行下游分析，并将分析结果可视化，绘制火山图和热图 [...
-
可以再分享一下吗 这个失效啦 十分感谢
GATK3.8.0 运行卡住问题
GATK是生信行业内核心工具之一，目前版本已经更新到4.2以上。GATK4和GATK3相比，用法有较大变化，因为做生产追求稳定，比较忌讳频繁的变动，相信还有不少人依旧在使...
-
GATK3.8.0 运行卡住问题GATK是生信行业内核心工具之一，目前版本已经更新到4.2以上。GATK4和GATK3相比，用法有较大变化，因为做生产追求稳定，比较忌讳频繁的变动，相信还有不少人依旧在使...
-
多少算相似呢 有阈值吗
雅卡尔指数 (Jaccard index)
雅卡尔指数，或者称为交并比、雅卡尔相似系数，可以用于比较样本集的相似性与多样性。其定义为两个集合交集大小与并集大小之间的比例： 雅卡尔距离（Jaccard distance）...
-
@天涯清水 我的数据是tpm表达谱 我只是想请教一下去批次之前需要log一下表达谱吗 还是直接去批次
多种批次效应去除的方法比较-转自生信技能树
多种批次效应去除的方法比较 原创 生信技能树 前面我在生信技能树推文：你确定你的差异基因找对了吗？ 提出了文章的转录组数据的60个样品并没有按照毒品上瘾与否这个表型来区分，而...
-
请问博主 表达谱数据用的是什么值呢 tpm吗 去批次之前需要log吗
多种批次效应去除的方法比较-转自生信技能树
多种批次效应去除的方法比较 原创 生信技能树 前面我在生信技能树推文：你确定你的差异基因找对了吗？ 提出了文章的转录组数据的60个样品并没有按照毒品上瘾与否这个表型来区分，而...
