努力努力再努力~<br>个人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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ChromHMM：染色质状态发现和表征ChromHMM 是一个基于隐马尔可夫模型（Hidden Markov Model, HMM）的计算工具，它用于系统地鉴定和表征基因组中的染色质状态。这些状态通常与不同的基因...
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单细胞转录组流程一：安装运行cellranger及结果解读
单细胞分析流程之Cell Ranger 相信做单细胞的小伙伴对Cell Ranger这个软件都不陌生，我们今天就来了解一下Cell Ranger的安装和使用方法。Cell R...
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hisat2比对软件将reads比对到参考基因组
转载：https://biozx.top/hisat2.html[https://biozx.top/hisat2.html] HISAT2是TopHat2/Bowti2的继...
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利用TrimGalore去除adapter以及过滤fastq文件学校网课笔记~ 今天的网课主要介绍怎么把原始的fastq文件根据fastqc结果进行去接头、以及过滤掉低质量的reads。 主讲人介绍目前主要使用的去接头/过滤的软件有三种：...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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2019意犹未尽的基因组可视化IGV（一）刘小泽写于19.6.8之前最开始学习IGV的时候写过两篇推文，当时简单做了了解，但有朋友说意犹未尽，嗯我也这么觉得，总觉得还是学的不够。推荐阅读：https://github...
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R包clusterProfiler: 转换ID、GO/KEGG富集分析参考这篇ID转换不用怕，clusterProfiler帮你忙这篇详细讲了无参考基因组该怎么办，值得一看 简单介绍一下几种常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG开头...
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我眼中的barcodes.tsv.gz/features.tsv.gz/matrix.mtx.gz前段时间一直在用cellranger count进行单细胞测序数据的处理，不得不说Cell Ranger作为10X Genomics官方的单细胞数据处理工具，功能还是很强大的...
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11.芯片数据GEO数据库下载一、基因芯片 基因芯片：由大量cDNA或寡核苷酸探针密集排列而形成的探针阵列，其基本原理是杂交测序方法。 cDNA芯片制作：通过克隆的方法获得目的cDNA序列，将其作为探针高...
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16.DO富集分析R语言代码及图的绘制首先，向给我留言及私信的小伙伴们说一声抱歉，我这段时间太忙了，很久很久没登录简书，所以留言和私信都没回复，抱歉啦；我看着留言和私信的时间比较久远了，也不知道小伙伴们的问题有没...
