240 发简信
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    1.8featureCounts

    htseq实在太慢了,尝试一下featureCounts1.下载安装https://sourceforge.net/projects/subre...

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    1.5构建支原体index并比对

    blast确定转录组污染为Mycoplasma yeatsii GM274B1.寻找基因组https://www.ncbi.nlm.nih.go...

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    1.4hisat2相关语句

    理解下列语句 活学活用 关于for语句的一点小问题 加上想要循环计算某一串数字+2 如果加上引号,就是字符类型而不是numeric了 参考文献 ...

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    1.3质控结果解读

    以最差的一个为例 总览 绿色勾勾:合格的黄色叹号:触到了警戒线红色叉叉:不合格 1.基础数据 reads长度=150GC含量=47%reads数...

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    1转录组fastq文件处理

    第一次转录组分析公司提供的数据为双端fastq.gz,省略了sra转换这步,sra转换为fastq这步可以以后再说了 数据校验 公司的测序文件提...

  • 1.2fastqc相关语句(理解find和ls的联合使用)

    理解下列语句 活学活用,寻找目录下所有md5文件并进行QC tips win挂载在mnt的共享文件,在linux中无法增加软连接(Operati...

  • 1.1md5校验相关语句(理解find和xargs)

    理解下列语句 活学活用,寻找目录下所有md5文件并进行校验 参考文献 linux find grep组合使用linux之find命令详解Linu...

  • 0.2安装转录组相关软件

    先更新python版本 参考:Ubuntu16.04系统查看已安装的python版本,及其配置 python --version #查看当前版本...

  • 0.1更新ubuntu早期版本至最新版本

    在vm上安装的ubuntu版本17.04默认不再支持更新 换成国内的源显示无法连接,通过修改sources.list中为 old-release...