下午4:00，咚咚！咚咚，有人敲门，顺便问句：谁呀？答楼上小高。 开门，只见她风尘仆仆，手里拎着个布袋子。我掐了些苜蓿芽，给你送点。 小杨一边说一边手伸...
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2021-09-20解决samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open share...
来源：https://blog.csdn.net/ET_April/article/details/111405941[https://blog.csdn.net/ET_Ap...
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从拟南芥的T0123代获得纯合株系，转基因必经之路！作为模式生物，拟南芥（Arabidopsisthaliana）主要有以下几方面的优势： 第一，拟南芥的基因组在常见的植物模型中是最小的，染色体数目也很少，只有五对同源染色...
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孟德尔随机化法（Mendelian randomization method）写在前面：知识真是越看越多，聪明的人类总能想出各种办法来寻找这世界万物中的各种联系。文献中读到Mendelian randomization method and a Men...
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有相关性就有因果关系吗，教你玩转孟德尔随机化分析（mendelian randomization ）
流行病学研究常见的分析就是相关性分析了。 相关性分析某种程度上可以为我们提供一些研究思路，比如缺乏元素A与某种癌症相关，那么我们可以通过补充元素A来减少患癌率。这个结论的大前...
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八. SNP检测和进化分析（Snippy）
一. 简介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP检测的软件，可以通过分析得到核心SNP，进行比对构建进化树。 ...
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75.《Bioinformatics Data Skills》之构建循环处理文件pipeline
生物信息学中，很多数据分散在多个文件中，任何pipeline处理的核心都是通过某种方式对每个文件运行相同的流程，并保持对样本的追踪（最简单的方式是通过bash的for循环）。...
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基础知识 — 基因组变异类型基因组变异是一个定义比较模糊的概念。 所谓的变异是相对于一个完美的“参考基因组”而言。但是其实完美的“参考基因组”并不存在，因为我们只是选择某一个物种里的其中似乎比较正常的个...
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linux-awk常用命令linux-awk常用命令 awk从放弃到入门[https://www.zsythink.net/archives/1336] 菜鸟教程[https://www.runoob...
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35.《Bioinformatics Data Skills》之生物信息文本处理利器bioawk
作为表格文本处理命令awk的延伸，Heng Li开发了专门处理生物信息学的文件（例如bed, sam, vcf, gtf等）的命令bioawk，我们了解一下。 简介 bioa...
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XP-CLR选择信号分析
检测基因组选择信号的方法有很多种，其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年发...
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snpEff注释变异位点信息SnpEff是一种变体注释和效果预测工具，它注释和预测遗传变异的影响（例如氨基酸变化）。 1. 软件安装 2. 运行 2.1 构建SnpEff数据库 SnpEff软件的运行，...
