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  • 通过密钥登录远程服务器

    第一步:通过客户端Git来生成密钥 后面的your_email@youremail.com改为你在github上注册的邮箱,之后会要求确认路径和...

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    Hisat2+FeatureCounts+DESeq2流程+作图!

    featureCounts是一个用来统计count数的软件,运行的速度飞快,比之前用的htseq-count快了好多好多。 照例先说一下怎么下载...

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    Seurat的scATAC-seq分析流程

    Seurat 3.X版本能够整合scRNA-seq和scATAC-seq, 主要体现在: 基于scRNA-seq的聚类结果对scATAC-seq...

  • CentOS7下安装hdf5r包

    使用Seurat安装hdf5r报错 安装hfd5r报错 1. 下载hdf5-1.8.13的源码 2. 编译安装 3. 设置环境变量 4. 重新安...

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    R语言ERROR解读|failed to lock directory

    今天升级rlang的时候报了错: 这时如果查看对应安装包的文件夹(例子中是win-library/4.0),会发现多了一个叫做“00LOCK-r...

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    高通量测序中的接头(adapter)到底是什么

    首先放一张测序示意图,在DNA片段两端所加的序列即接头序列,也就是我们今天要讲述的主角。 1 基本概念 1.1 adapter 接头,为一段已知...

  • Linux给文件中每一行的前面、后面、指定列添加/删除相同字符

    需要用到shell命令awk在前面、后面、指定列添加相同字符(1)给一个文件中的每一行开头插入字符的方法: (2)给一个文件中的每一行结尾插入字...

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    回顾illumina 双端测序原理

    回顾二代双端测序原理 双端测序 上样 flowcell是用于吸附流动DNA片段的槽道,测序就在此进行。lane上随机分布两种接头,p5‘(与P5...

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    pandas实现筛选功能方式【探索AnnData数据格式】

    1. 筛选出数据的指定几行数据 adata.obs[1:10] 2. 筛选出数据某列为某值的所有数据记录 adata.obs[adata.obs...