可变剪接(Alternative splicing)：一个基因的外显子以不同的组合方式剪接形成不同的成熟RNA，由此产生的不同的 mRNA 可能被翻译成不同的蛋白质构体，因此...
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2021-04-30 可变剪接与rMATS分析 -
文献分享33：泛基因组分析揭示了与黍稷驯化相关的基因组变异文献 2023 Nature Genetics Pangenome analysis reveals genomic variations associated with d...
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生信分析32：deeptools软件介绍Fig 1 对于各种表观组学，如ChIP-seq、ATAC-seq、CUT&TAG、MNase-seq，deeptools是下游分析中非常常用的软件之一。该软件发表于2014...
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文献分享32：表观遗传修饰调控小麦品种特异的根系发育和对氮素可利用性的代谢适应文献 2023 Nature Communications Epigenetic modifications regulate cultivar-specific root ...
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生信分析31：基于metilene鉴定差异甲基化区域目前，WGBS（Whole genome bisulfite sequencing）仍是检测全基因组DNA甲基化的金标准。下游分析中，鉴定差异甲基化区域（Differenti...
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文献分享31：多组学分析揭示了野生大麦在进化坡（Tabigha）的土壤适应机制文献 2021 Advanced Sciene Multi-Omics Analysis Reveals the Mechanism Underlying the Edaph...
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生信分析30：基于二代转录组测序检测APA事件本次推送是文献分享30的对应内容。 多聚腺苷酸化 (ployA) 是真核生物中一种重要的转录后调控机制，它调节 pre-mRNA的成熟。 对于很多基因来说，该过程可以发生在多...
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文献分享30：植物生长阻滞诱导石榴矮化的全基因组范围选择性多聚腺苷酸化特征文献 2023 Frontiers in plant science Genome-wide alternative polyadenylation dynamics und...
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生信分析29：基于单拷贝直系同源基因构建物种进化树本次推送是文献分享29的对应内容。 Fig 1 基因组和比较基因组相关的文章中，最常放的一个图是对该物种和其他近缘物种以及外群构建系统发生树（Fig 1），用来研究物种的进化...
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文献分享29：异源四倍体豆科植物田菁的T2T基因组揭示了转座子驱动的亚基因组分化和碱胁迫耐受机制文献 2023 Science China Life Sciences Telomere-to-telomere genome of the allotetraploid l...
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文献分享28：scRNA-seq揭示棉花侧生分生组织再生能力的分子机制文献 2023 Genome Biology Single-cell resolution analysis reveals the preparation for repr...
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生信分析27：基于Ks计算全基因组复制事件全基因组复制事件（WGD）是某物种的全部染色体由于某种原因整体发生复制而加倍的事件。整体加倍可以是增加一倍，即二倍化事件，也可能增加了两倍，即三倍化事件。 大多数被子植物都经...
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生信分析26：对LTR-RTs构建进化树本次推送是文献分享26的对应内容。我与生信，公众号：我与生信文献分享26：优质牧草羊草的基因组演化与育种[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mz...
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文献分享26：优质牧草羊草的基因组演化与育种文献 2023 PNAS Genome evolution and initial breeding of the Triticeae grass Leymus chinen...
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文献分享24：六倍体小麦胚胎发育过程的表观调控文献 2023 Genome Biology Dynamic chromatin regulatory programs during embryogenesis of he...
