比较基因组学分析目录 1:单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2:基因家族收缩与扩张分析[ht...
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1. 组装基因组质控 得到组装好的基因组序列之后,首先要使用多种方法评估组装质量。这里用到2款可用于基因组组装质量评估的软件——QUAST和BUSCO。 1.1 quast—...
前几天,实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析,没想到却在多序列比对这一环节出现了棘手的问题。...
这篇文献可能不是很好理解,现在还没有读完。文献已经存在noteexpress上。 在这篇文章中发现了两个比较好使的工具,记录一下。 1. [AGAT]https://gith...
关于tssRegion参数: 理解:1、TSS是: 转录时,mRNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基它的上游是promoter它的下游就是相应的基因 2、做注释的时候,需...
1.下载conda(anaconda/miniconda) 适时的选择enter/yes/no 2.配置环境 编写 3.退出重进 4.创建环境 5.激活环境 6.搜索 7.安...
一、有性繁殖 植物体产生有性生殖的细胞,两个配子相互融合后形成合子或受精卵。 被子植物花的组成以及花芽分化,被子植物的生命周期是从种子萌发开始的,经过营养生长形成根、茎、叶三...