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    一对多数据的互换

    我们的目的是要将以下格式的数据相互转换。 暂时没有找到一部到位的方法,只能使用较为繁琐的方法进行转换。 1 对数据进行长数据化 2. 拷贝到ex...

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    修改SRA已上传的数据信息

    已上传SRA的数据信息,可以登录后通过数据修改页面进行修改。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/docs/subm...

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    edgeR的简单实用流程

    前些天,实验室里的同事,为了补充计算几个比较组合的差异分析,花了几千元,真够冤枉的。但碍于我们实验室对生信技术的鄙夷,我也懒得理睬。这里简单介绍...

  • 非参数检验-计算部分

    非参数检验,一般是在分布未知的情况下使用。我们首先会先对数据进行正态检验和方差齐性分析,如果均不服从,则对数据进行变化,如果还是不服从,则进行非...

  • R中read.table()漏行的问题

    read.table()和read.delim()是我们常用的表格读入命令。但有时候会出现读漏行的情况。 原本4274的数据,读取后只有3829...

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    R安装包报错-“had non-zero exit status”

    在使用remotes::install_github安装包的时候,出现“ had non-zero exit status”的报错。 提示已经下...

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    用R提取非表格的特定行

    有时候我们需要提取非表格文件中含有某些符号的特定的行,例如,我们需要从下面fasta文件中提取所有包含">"的行, 基本思路是逐行读入,定位,按...

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    TopGO出图的简易方法

    GO富集出来的结果可以非常多,如果没有一个层级显示,将会非常眼花缭乱。TopGO则通过DAG(Directed acyclic graph)解决...

  • 两列data frame转换成带行名的vector

    从两列的数据框转变成第一列为行名的向量,两列数据读入,如下: 要转变成如下向量: 具体思路是先转变成矩阵,设定行名,提取数据,最后转变成向量。设...