发简信
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基因组CRISPR序列及Cas酶预测原文链接：基因组CRISPR序列及Cas酶预测[https://mp.weixin.qq.com/s/ayOydVsG44Fdl41Uyuja4...
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Iqtree2：新模型高效构建系统发育树
系统发育推断（phylogenetic inference）的算法五花八门，从最简单的UPGMA法，到邻接法（neighbor joining）...
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关于生物进化，研究者们存在哪些分歧？
关于生物进化目前最大的争议是什么？ 原文链接：关于生物进化，研究者们存在哪些分歧？ 距离达尔文《物种起源》一书问世已经160多年了，然而毫无疑问...
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基因组相似性计算：ANI
在比较基因组分析中，我们经常需要分析不同基因组之间的进化关系，例如我们可以使用标记蛋白来构建系统发育树。为了进行定量的比较，我们还可以计算不同基...
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组间差异分析：Metastats
文章来自公众号：微生态与微进化 Anosim、Adonis、MRPP等基于群落的组间差异分析可以快速的对分组的有效性进行评估。然而，有时候我们还...
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神秘的细菌基因组：GC skew
科学就是整理事实，以便从中得出普遍的规律和结论。from 达尔文 原文链接： 每当我们拼接出一个完整的细菌基因组时，总是迫不及待地画出它的图谱，...
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微生物群落展示：要酷酷的云字体！原文：微生物群落展示：要酷酷的云字体！ 每当你需要展示微生物的群落结构 你是不是已经厌倦了 无休止的条形图和热图 想不想要更大胆前卫的展示方式？...
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组间差异分析：Anosim无论是野外环境样品，还是室内试验样品，一般我们都会设置样方或平行样来增强分析的准确性，必要时还会进行区组设计，因此在数据分析中需要进行组间差异的...
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好书推荐——病毒宏基因组学：方法和指南
目前爆发的新冠状病毒再次让人们意识到了病毒的重要性。病毒不仅可以使包括人在内的动植物致病，也对生态与进化有着重要的作用，然而目前人们对其却所知甚...