发简信
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CUT&Tag数据分析实战-更新
fastqc 0.12.1 [#Nextera Transposase Sequence & PolyG] ktrim 1.5.0 alignm...
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两个Bigwig文件相减
bigwigCompare --bigwig1 teatment_rep1.bw --bigwig2 control_rep1.bw --ope...
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5. Peak 注释
在之前通过macs2得到了差异peaks的数据，现在利用ChIPseeker包进行注释。参考：CS2: BED文件[https://mp.wei...
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4.CUT&Tag 基础分析&数据汇总2
需要文件：seacr/;bam/ 加载R包： 输出文件:file1 = left_join(peakN, peakOverlap, by = c...
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3.CUT&Tag 基础分析&数据汇总1
需要文件：bowtie2_summary/;bowtie2_summary/;fragmentLen/;binLen/ 加载R包： 设置路径 输...
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2.CUT&Tag 数据分析实战（2）
接上回[https://www.jianshu.com/p/1d826a65fd59]，得到 bedgraph 文件了。重要秘籍: In-dep...
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The index file is older than the data file:状态已经癫狂了。DiffBinddbObj <- dba.count(dbObj, bUseSummarizeOverlaps=TRUE)一直报...
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Warning message: incomplete final line found by readTableHeader
在读取CSV文件时，报错如下：> a <- read.csv('SampleSheet.csv',sep=",",header=T)Warnin...
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R中如何读取mac磁盘u盘路径
想读取在mac上的u盘中文件，但是找不到路径。> setwd('UPan')Error in setwd("UPan") : 无法改变工作目录 ...