MGCA Microbial genome component and annotation pipeline Introduction The...
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MGCA：微生物基因组组分与注释管道 -
CAZy碳水化合物活性酶预测CAZy数据库简介 CAZy 全称为Carbohydrate-Active enZYmes Database，碳水化合物酶相关的专业数据库，内容...
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PGCGAP v1.0.35版本更新
PGCGAP 是用于原核生物基因组学和比较基因组学分析管道，目前该管道包含 12 个模块，可以接受 Illumina 双端 reads、Oxfo...
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利用PGCGAP根据ids提利用PGCGAP根据id提取序列信息
使用场景 假设有一个 fasta 格式的序列文件SRR9620252.faa，我们想要提取其中的一些序列到一个新的文件中，我们拥有这些序列的 i...
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一个神奇的小软件bioawk刘小泽写于18.7.29 写在前面：之前介绍过文本处理的三剑客，grep、sed、awk，也曾说过，学了awk，让一切字符秒变尴尬“awk wo...
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【群体遗传】Fst（群体间分化指数）（1）是什么？含义是什么？ ，全称为fixation index，是一种用于衡量群体间分化程度的统计检验量（由Wright's F-statis...
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神器 | 计算Non-coding序列选择压！KaKs_Calculator 3.0 重磅发布~写在前面 早前我在 TBtools 中基于NG86逻辑实现 Ka/Ks 计算时走了不少弯路，其中种种，或许只有 Coding 的人才知道。当然，...
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聊聊“基因组共线性”最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送，发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这是两个完全不同的概念，前者主要...
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GSVA分析
GSVA其实就是pathway级别的差异分析[https://www.jianshu.com/p/8817dbaee8dd]，根据GSVA[ht...
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按照热图聚类结果来给样本分组1.需求 如图，热图自带聚类树，将样本(列)分成了三个簇。想要按照聚类的结果，获取到 的信息，并将这个信息添加到热图上。 2.作图的数据 输入数...
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