生信算法 - 专题

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生信算法

收录了32篇文章 · 101人关注

HMM与维特比算法在基因组序列中的应用
前言受启发于一篇文献Parent-independent genotyping for constructing an ultrahigh-d...

0.1 小潤澤 0 2
三个 Alignment-Free 的 RNA-seq 表达量估计软件的 "Alignment" 逻辑
学位论文整得七七八八了。回首过去三四年，感觉“在技术上”落后的“大体同时”接触生信的朋友们。或者这就是人生，或许得到了什么，或许失去了什么。怀念...

0.6 生信石头 1 8

数据标准化方法：该如何选择？
原文链接：数据标准化方法：该如何选择？什么是数据标准化？在微生物组学数据分析之前，我们常常需要根据数据量纲的不同以及分析方法的需要对数据进...

0.3 SYSU星空 0 6
算法（一）截取reads的算法
原创：hxj7 关键词：phred; trim; mott; NGS（二代测序）分析的起点往往是fastq文件。fastq文件其实就是一条条的记...

0.7 生信了 0 3
层次聚类分析案例（三）
之前的笔记：聚类介绍：点这里层次聚类分析案例（一）层次聚类分析案例（二）案例三：基因聚类获取全基因组表达数据的能力是一项计算复杂度非常高的任...

0.5 11的雾 0 5
层次聚类分析案例（二）
之前的笔记：聚类介绍：点这里层次聚类分析案例（一）案例二：亚马逊雨林烧毁情况 1999～2010年，33000平方英里（85500平方公里），...

0.3 11的雾 1 3
层次聚类分析案例（一）
关于聚类分析的介绍，可参见本人之前的笔记：聚类分析案例一：世界银行样本数据集创建世界银行的一个主要目标是对抗和消除贫困。在这个不断发展的世界...

0.3 11的雾 2 5

聚类分析（Cluster Analysis）
（一）什么是聚类聚类，将相似的事物聚集在一起，将不相似的事物划分到不同的类别的过程。是将复杂数据简化为少数类别的一种手段。（二）聚类的基本思...

0.4 11的雾 0 8
blast算法初探
在前面我们探讨了两条序列是如何通过动态规划算法进行比对的，但是在现如今的拥有海量数据的数据库中，想直接通过动态规划算法来将所有的序列与query...

井底蛙蛙呱呱呱 3 12
用人话讲明白近邻算法KNN
目录 1.KNN简介2.KNN算法步骤3.决策边界4.K的选择5.要注意的问题6.小结 1.KNN简介 KNN（K-NearestNeighbo...

1.5 化简可得 0 7