导读 用R软件corr.test函数进行两组数组的相关性分析,用Cytoscape绘制相关网络图。 一、输入数据 代谢数据:metabo.txt...
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相关系数计算:相关系数、P值 相关系数作图 补充ggcorrplot 更详细的作图细节可参考:https://www.jianshu.com/p...
最近在看植物长链非编码RNA的内容,数据分析里有个一内容是预测lncRNA的反式作用元件,通常的做法是利用表达量数据计算皮尔逊相关系数,然后设置...
一. 简介 corrplot包是一个画相关系数图的包,可以用来对基因的表达数据进行分析,分析不同基因间表达的相关性。 二. 实例 1. 数据格式...
Ref: Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by ...
本节概览:1.获取DEG结果的上下调差异基因2.bitr()函数转化基因名为entrez ID3.利用clusterProfiler进行KEGG...
获取本章节数据和代码:关注微信公众号:小杜的生信筆記(ID:Du_Bioinformatics),回复关键词:limma差异分析 -------...
一、获得注释包中的GO信息 二、下载最新的KEGG数据库 三、将GOid转化为term 四、计算词条相似性 计算相似性的原理可以参考:https...
转录组分析是生信分析的一个基础和常见的分析流程,一般从下机数据开始,经过一系列的质控,基因组比对,差异分析等过程得到实验组与对照组(或者肿瘤中的...
刘小泽写于18.10.24最近开始写第一篇英文小论文,练练手,为将来写英文大论文做准备 目录 1 背景 Background Types of ...
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