Interpro数据库 Interpro是集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余蛋白质特征序列数据库， Interpro数据库成员包括Coi...
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interpro 注释结果简单分析及可视化 -
如何从基因组水平检测分子趋同进化信号趋同进化，是指亲缘关系较远的两个或多个类群由于长期处于相似的生活环境，受到相似的选择压力的影响从而进化出相似的功能或表型特征。例如，鸟类与蝙蝠为...
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【基因组学】好用的基因组学工具jcvi的安装及无root权限安装latex
写在前面 jcvi是福建农林大学的唐海宝老师开发的一款针对基因组处理的高效工具，学好这一个工具可以解决80%以上遇到的基因组学上的问题。 安装j...
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物种间共线性图参考：https://blog.csdn.net/u012110870/article/details/102804593https://www...
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关于PhastCons和SIFT4G的使用
由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列，以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性，经过一段时间的探索，对这两款软件已经有了...
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LDheatmap | SNP连锁不平衡图（LD）可视化，自己数据实现版！
本文首发于“生信补给站”，https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oMpufPg 连锁不平衡图，用来...
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RIdeogram：染色体数据可视化的R包已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体，又如R包chromoMap，IdeoViz，karyploteR，ggbio和在线工具Idiog...
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GDAS009-Bioconductor中的基因组注释
title: GDAS009-Bioconductor中的基因组注释date: 2019-09-06 12:0:00type: "tags"ta...
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纯二代测序从头组装基因组基因组组装 基因组组装一般分为三个层次，contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(re...
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如何对基因组序列进行注释基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de ...
专题公告
基因组变异检测
变异分析
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