title: muma-代谢组学单变量和多变量统计分析R包date: 2019-02-23 21:38:55tags: [单变量, 多元统计, ...
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muma-代谢组学单变量和多变量统计分析R包 -
MetaboAnalystR包灵活、可重复的分析代谢组数据R包文档参考：https://www.metaboanalyst.ca/docs/RTutorial.xhtml#Workflow:%20Cas...
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潜在因素混合模型：LFMM—— R包lfmm在自然群体（区别于强人工选择）中，如果我们感兴趣的数量性状表现出与特定的地理环境变量有高度的关联性，随着环境变量的改变而变化，则这些环境变量往往...
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用ropls进行代谢组PCA, PLS, PLS-DA, OPLS, or OPLS-DA分析简介 主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是对变量数超过样本数量或变量之间存在多重共线性的组学数据进行可视化、回归、分类和特征选择的常用...
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如何在CNGBdb存储代谢组数据？
你的组学数据都存在哪里？NCBI，EBI....除了这些你还可以选择国家基因库生命大数据平台（CNGBdb）。 2020年7月31日，国家基因库...
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R package：MAIT峰注释
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R package：MALDIquant质谱峰的可视化安装 查看MALDIquant包带的数据 共有16个样本 标准化 减少峰的波动，克服方差均值的相互影响
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R package（一）：xcms代谢组学初探xcms用于LC-MS和GC-MS数据分析，用于色谱分离和单光谱质谱数据处理和可视化的框架。导入AIA / ANDI NetCDF，mzXML，...
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KEGG数据库：查找某个通路上的所有基因
1.kegg数据库下载 通常我们如果已知某个基因，想对这个基因做通路很简单，直接用kegg的网页注释就可以；如果想知道某个通路里相关的所有基因列...
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