生物分子网络构建和分析 - 专题

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收录了25篇文章 · 56人关注

分享一个共表达网络矫正的方法
如图： Github: https://github.com/leekgroup/networks_correction/tree/master...

0.1 小潤澤 0 1
学做NAR图表：ggraph做网络图
最近在NAR上看到一篇文章：原文网络图如下：我们借此机会，通过ggraph作图解析相关参数。详细注释代码和参数已上传QQ群文件！我做的图如下...

3.8 KS科研分享与服务 0 22

R语言～绘制网络图
加载工具包加载数据定义一些颜色筛选优势物种构建函数计算相关性和共现性网络运行函数，生成结果输出结果，在gephi中进行精加工

0.2 Oodelay 6 3
多层网络可视化工具（MuxViz）
manlius/muxViz: Analysis and Visualization of Interconnected Multilayer ...

0.4 可能性之兽 0 3
单细胞加权基因共表达网络分析scWGCNA-01
scWGCNA是一个生物信息学工作流程，是R包WGCNA[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coex...

1.8 whitebird 1 28
R语言可视化（四十）：网络图绘制
40. 网络图绘制清除当前环境中的变量设置工作目录使用igraph包绘制网络图使用ggraph包绘制网络图使用networkD3包绘制...

1.7 Davey1220 3 20
WGCNA+代码实战（持续补充中）
什么是WGCNA 1 样本聚类，查看是否有离群值 2. 找构建网络合适的阈值左图纵轴：相关系数的平方，越高说明该网络越逼近无网络尺度的分布。右...

4.9 PriscillaBai 10 46

使用WGCNA进行meta-analysis
鉴于大量的转录组数据，可能出现的一个问题是“如果A组和B组都进行了转录组研究并报告了一些结果，这些结果的相容性如何？”目前基于转录组或芯片数据进...

1.4 nnlrl 2 19 1
R数据可视化21:Edge Bundling图
N久没有更新了，最近一段时间有点繁忙。今天，一起来学习一下一个和Circo图差不多的图：Edge Bunding图（不知道中文咋翻译）。其实在我...

3.3 jlyq617 10 56
网络-visNetwork包绘制炫酷的动态网络图
visNetwork是一个用于网络可视化的R包，使用的是vis.js javascript库(http://visjs.org[http://v...

2.5 JeremyL 8 19