看到了jimmy老师的下述文章，才发现之前写的RNAseq实战还漏了个转录因子富集分析：常规转录差异建议都加上一个转录因子数据 (qq.com)...
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转录因子富集分析 RcisTarget 2022-06-22 -
RNA-seq入门实战（十）：PPI蛋白互作网络构建（下）——Cytoscape软件的使用本节概览：1. Cytoscape 软件基本介绍2. 数据导入：蛋白互作节点信息导入、其他注释信息的导入3. PPI网络图绘制：➀选取部分节点展...
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理论 | edgeR -- TMM normalization 详细计算过程
最近在看差异分析当中原始read counts是如何被校正的，自然就不会放过差异分析的经典之一 —— edgeR. edgeR使用的校正方法称为...
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edgeR差异基因分析的一般过程基于转录组测序获得的定量表达值，识别差异表达变化的基因或其它非编码RNA分子，实际上方法还是非常多的。但就目前来看，DESeq2和edgeR是出...
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基因本体论介绍 Gene Ontology overview本体是给定域内的知识体系的正式表示。本体通常由一组具有在它们之间运行的关系的类（或术语或概念）组成。基因本体论（GO）从三个方面描述了我们对生物...
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基因本体论（Gene Ontology）首先，基因本体论（Gene Ontology）和基因文库不是同一概念。 我从下面几个方面讲一下GO的一些概 念和基本方法（感谢刘老师提供的资料）...
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基因本体论一、什么是生物学功能 根据Paul D. Thomas的说法，现在关于什么是生物学功能的讨论主要有两种："causal role functio...
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假设检验 p-value，FDR，q-value
1、p-value 单个假设检验中主要依靠p值(或统计量t)做出是否拒绝零假设H0的决定：p-value和预先设定的检验水准 α 做对比，如果p...
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p-value，p-adjust，q-value
(109条消息) p-value，p-adjust，q-value三者的定义与使用_小C_先生的博客-CSDN博客_adjust p value...
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多组差异基因富集分析结果聚类 | 获得共表达term的富集图本教程问题：1.mmGO.rdata文件的制作，是否不需要这一步，更改一下脚本即可实现呢？2.这样的图形美化，目前的图还不是很满意，需要进行美化...
专题公告
收录GO，KEGG，PPI，GSEA，差异分析，WGCNA等相关分析
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