1.GO富集 使用orgDb 通过使用Bioconductor的AnnotationHub在线检索并抓取OrgDb。非模式基因GO富集分析：以玉...
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玉米转录组的KEGG和GO富集分析 -
做出漂亮的序列比对alignment图——ENDscript/ESPript大家经常在文献中看到非常好看的序列比对图，现在笔者将目前见过的最好看的序列比对图的作图方法作分享，希望对大家的科研工作有所帮助，效果图如下： 1...
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好好学！这技术值一篇Plant physiology！今天看到Plant physiology在线发表了一篇文章。 In this study, we developed a software pa...
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通过VCF文件制作定制化的参考基因组
前言 最近做的项目要对reference genome基于突变进行一些modify，制作personalized genome或者说是psued...
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SR4R数据库：水稻4个SNP集的筛选及其应用前言 王向峰老师2020年发表在《Genomics Proteomics Bioinformatics》（IF=6.597）上的文章。对于做数据...
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autoSeqMan:批量Sanger测序结果处理、拼接昨天送样的sanger测序结果返回来了，可是看着ab1文件和seq文件我就有点头疼，一个一个来处理肯定是不适合我这个懒人的，一定要来批量处理的，...
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氮循环对应KO号https://www.genome.jp/kegg/ko.html KEGG Orthology 简称KO, 对于每个功能已知的基因，会把和其...
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【samtools】运行报错: error while loading shared libraries：libcrypto.so.1.0.0或libncurses.so.5或libtinfow...samtools用conda安装后，总是出现共享库缺失的报错。即便你刚安装samtools时可以用，但后面在同一环境中安装其他相关软件，有可能产...
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贴心 | GXF Fix 修复 / 优化基因结构注释信息文件 - GTF/GFF3写在前面 目前基因组测序和组装成本几乎已经到任何一个课题组都可以单独负担的价码，大量物种的基因组序列被测定和释放。与此同时，对应的基因结构注释信...
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如果gff文件出错，如何矫正基因结构注释文件？什么？基因注释文件出错？ 往下看！ 有时候在做进化树+结构域这种组合图时，会发现偶尔有个别基因的结构域与同一基因家族的其他成员相比，会出现“缺胳...
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