前言 前面，我们介绍过了差异基因的功能富集分析，今天，我们对这部分的内容作一些补充 主要介绍一下 GEVA、ssGSEA 和单基因的富集分析 G...
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TCGA 数据分析实战 —— GSVA、ssGSEA 和单基因富集分析 -
自己模仿画个-- m6A distribution on transcript前不久看到一篇发表在 Cell Reports 抗病毒和m6A相关的文章 Post-transcriptional regulation of ...
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思路清奇SCI:08.非肿瘤生信-Atherosclerosis（1.7分）无意中发现一篇生信文章，分数不高，思路值得借鉴。 大佬说：复现是学习R语言最好的办法。 其实这句话，在生信文章套路中同样适用的，即： 复现是学习...
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TCGA数据挖掘入门---任意基因的任意分组比较任意基因的任意分组比较是生信技能树[生信爆款入门课程]TCGA数据挖掘部分提到的一个重点。为拓展课堂所学知识，现在对其做下练习巩固和总结。 1....
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【r<-包】使用GenomicDataCommons包下载和处理TCGA数据
资料来源该包手册。R社区已经有不少下载和处理TCGA数据的包，但目前能获取最新GRch38的应该只有TCGAbiolinks和本包，本包也是TC...
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CNV变异和中级绘图今天可能双11，生信微信推送很多都暂停，只有一篇关于CNV变异的推送，其次今天进一步学习了先前的推送--中级绘图 CNV变异指的是拷贝数变异，与...
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10X scRNA免疫治疗学习笔记-5-差异分析及可视化刘小泽写于19.10.17笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索10X Genomics技术相关的分析课程链接在：http://jm.g...
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R数据可视化7:气泡图 Bubble Plot“气泡图”这个名字听着就很可爱是不是！今天让我们来看看这个气泡图长什么样，可以展示什么样的数据，以及如何用R作图。 什么是气泡图 气泡图（Bub...
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maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总，分析和可视化
本文首发于公众号“生信补给站”，https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介绍了使...
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复现详解：纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度一 . 从GEO数据库中下载表达矩阵文件 GSE112996_merged_fpkm_table.txtGSE112996_series_mat...
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