导读 关于如何将差异分析所得（上调或者下调）的代谢物进行KEGG通路的一个展示，除了利用大家熟知的Metaboanalyst[1]，以及R软件包...

各个软件列表和优缺点如下： 1、XCMS XCMS是2006年发布的、基于R语言的用于LC-MS数据处理分析的软件[2]。该软件是命令行驱动的，...

MSEA 什么是MSEA MSEA，Metabolite Set Enrichment Analysis，代谢集富集分析，是代谢组数据分析方法的...

导读 通路富集分析技术对于理解代谢组学数据背后的潜在生物学意义是非常有用的，它们的目的是根据代谢途径中所包含的先验知识，为受影响的代谢物提供上下...

非靶向代谢组实验设计 1.代谢物提取，一般要求每组至少10个样；2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC；3.QC样本与实验样本穿插上机，开始...

Create test data Now plot Order levels 链接地址：http://blog.sciencenet.cn/bl...

一：创建矩阵： # Create test matrixtest = matrix(rnorm(200), 20, 10)test[1:10, ...

感觉100年没有上简书，近2个月忙于毕业论文以及公众号推文，没有时间更文章。终于前几天交了论文呢，可以回来更文了。没错我只是在为我的懒惰寻找接口...

环境：R_x64_4.0.2 & RStudio_1.2.1335相比网站生成火山图，使用R语言生成火山图可以满足更多的要求，但相关文章不甚清晰...

火山图 火山图用于展示基因表达差异的分布，横轴为Log2 Fold Change，越偏离中心差异倍数越大；纵轴为(-1)*Log10 P_adj...