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生信
收录了13篇文章 · 16人关注
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    基因组大小

    用Kb （千），Mb（百万）、Gb（十亿）为单位描述基因组的大小。 bp = base pair(s)=一个碱基对 kb (= kbp) = k...

    1.1 皮皮pig 0 6
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    宏基因组数据分析流程代码

    熊金波实验室出品 整理归纳：Larry 本次学习使用的服务器IP地址和其用户名账户密码如下： 地址：gs0.genek.tv 用户名：u3276...

    7.4 Larrylu007 10 106
  • breakdancer-CNV

    在安装时，使用conda 进行安装， conda install -y breakdancer 安装完，运行 bin/bam2cfg.pl 报错...

    0.1 烟花伊冷 0 1
  • 滑动窗口，并计算每一个窗口的SNP个数

    数据类型 输出结果

    0.1 余绕 0 1
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    circos使用笔记

    circos是用来展示数据的绘图工具，其数据展示方式主要通过配置文件来决定。不同的展示方式可通过不同的配置文件来进行设置，如染色体整体展示，添加...

    1.4 井底蛙蛙呱呱呱 2 23 1
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    Python3 提取CDS

    根据物种基因组和注释文件，可以编写脚本，提取特殊的序列结构，完成个性化的分析。本文利用Python3提取拟南芥的最长编码序列，并转化为氨基酸序列...

    1.6 香波地海 6 11
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    如何上传转录组数据到NCBI的SRA数据库

    建议大家把数据上传到我们自己的数据库（http://bigd.big.ac.cn/），支持国产。由于我的数据太差了，还是传到NCBI吧~ 第一步...

    0.1 纤蹄马 0 3
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    RNAseq 必读综述和在线教程

    最近读到一篇博文，介绍了学习 RNAseq 数据分析非常推荐的两篇综述和七个在线教程并发表了相关评论。本文将进行简要整理并对相关评论内容进行大致...

    11.4 思考问题的熊 1 80 1
  • 国内第一篇植物单细胞测序

    之前关注王佳伟在植物发育阶段转变过程中调控机制的研究，洲更在生信界也是大名顶顶，不知道他们是一个课题组的。用到的统计方法有：t-SNE和UMAP...

    纤蹄马 1 1
  • windows 下的blast+安装以及使用

    blast+的安装 1.程序下载：访问blast本地软件包链接 blast_latest下载适合自己系统的blast版本。2.安装流程：下载完毕...

    1.0 井底蛙蛙呱呱呱 10 28