编者按: 抑郁症是一种常见的精神疾病,但目前的治疗方法只对一小部分人有效。为了确定新的治疗靶点,美国埃默里大学医学院神经内科Thomas S. ...
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最近在看遗传数据与表达结合的东西,介绍一个经典的方法吧,fusion。 Gusev et al. “Integrative approaches...
作者:Resther审稿:童蒙编辑:angelica 什么是TWAS 对GWAS(genome-wide association study, ...
孟德尔随机化--初筛 各位观众老爷们大家好,欢迎来到蟹道人的生信小课堂! 本节内容我们主要讲解如何进行孟德尔随机化暴露与结局的快速初筛。 主要列...
一、暴露因素的数据要求: 1.对于暴露因素的GWAS数据,TwoSampleMR需要一个工具变量数据构成的data frame,每行对应一个SN...
1. 安装孟德尔随机化分析相应的R包 2. 概述: 孟德尔随机化流程如下: 选择暴露的工具变量(筛选显著的SNP[P < 5e-8],并进行LD...
TWAS简介 全转录组关联分析 (TWAS, transcriptome-wide association studies) 是把转录调控(ex...
项目内容 流程简介 软件安装 参考数据介绍 GWAS数据 安装Fast2TWAS包 GWAS数据的预处理 LDSC计算遗传相关性 LDSC计算p...
1、eQTL、mQTL共定位分析的作用 eQTL、mQTL共定位分析属于Post-GWAS的一项重要工作,旨在GWAS结果的基础上鉴定与表型相关...
单核苷酸多态性(SNPs)是人类最常见的遗传变异,是研究疾病遗传基础的宝贵资源。在相关疾病研究中,常常涉及将基因表达的变异与基因型联系起来的表达...
专题公告
孟德尔随机化 gwas