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收录了18篇文章 · 7人关注
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    富集分析圈圈图

    0.需求解读 这是富集分析比较常见的一个图,左图右表。 图的最外层是GOterm的编号,中间灰色背景层表示基因的logFC分布,可以看到每个te...

    2.9 刘小泽 2 33
  • R 数据可视化 03 | 圈图

    成品预览 一、环境需求 R 及 Rstudio 的安装配置 一步一步安装及配置R及Rstudio(详细图文) RCircos安装 二、绘制圈图 ...

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    基于R语言绘制坐标轴截断图

    画图时经常遇到不同组的数据大小相差很大,大数据就会掩盖小数据的变化规律,这时候可以对Y轴进行截断,从而可以在不同层面(大数据和小数据层面)全面反...

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    一文读懂进化树(图文详解)

    一、什么是进化树 系统发育进化树 (Phylogenetic tree):** 一般也叫系统进化树,进化树。它可以利用树状分支图形来表示各物种或...

    0.9 白墨石 0 25
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    circos图

    绘制circos图一般需要上图中的三个文件。 一:染色体配置文件 主要是染色体的位置,名称,颜色的设置。其中第三列你可以改成想在图上显示的名字,...

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    R package:circlize环状热图

    1.读取基因表达数据 这是我的基因表达量数据 1.1提取部分数据集 1.2提取基因表达值所在的列,组成新的矩阵,并将矩阵转置 为什么要转置,参考...

    1.7 佳名 1 22
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    一个看似简单的需求——修改富集分析的dotplot图

    刘小泽写于2020.2.6最近再一次做起了转录组,但这一次需求有点小改变,需要自己定制一下,具体原因看本文吧。其中要特别表扬花花💏同学,帮了个大...

    2.7 刘小泽 2 35
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    Smartseq2 scRNA小鼠发育学习笔记-1-前言及上游介绍

    刘小泽写于19.10.23笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索Smartseq2技术及发育相关的分析课程链接在:http://jm.g...

    1.6 刘小泽 4 22
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    复现-jimmy教程之 外显子可视化

    外显子定量 可视化 DEXSeq包是用来分析RNA-seq实验数据中exon的差异;这里exon的差异指的是由于实验条件导致的相对不同的exon...

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    以热图为例,展示图形可交互的有趣之处

    写在前面 Emmm... 学校网络或者电力应是出了问题,无法远程操作学校服务器。于是,好不容易的不碎片化的时间,还是没能用在工作上。既然如此,那...

专题公告

生物信息中,不同编程语言的数据可视化