一人默默学习inferCNV的时候，你或许需要看看别人的运行记录，这里我提供一份完整记录。 1. 代码 2.过程 INFO [2021-03-1...
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infercnv运行测试2---这个只有15步就完成了
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SCENIC运行SCENIC官网教程 SCENIC运行的数据准备 需要表达矩阵和细胞信息两个文件。 1.包的下载 2. 评分数据库的下载 手动下载两个文件，然后...
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使用SCENIC分析singlecell-RNAseq实战演练SCENIC全称：Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering实战之前需要准备...
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SCENIC
安装相关： 在服务器上安装SCopeLoomR时，输入如下 devtools::install_github("aertslab/SCopeLo...
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单细胞数据（scRNAseq）可以做GSEA吗？单细胞测序数据也可以做gsea，步骤跟用RNAseq的数据差不多，主要是要用到差异基因并且根据Fold change来排序。 选择自己数据的物种...
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单细胞转录组测序分析--再说Seurat上期我们讲了使用Seurat分析单个样本，那么2个或多个样本的分析会有哪些不同呢？单细胞转录组数据中一个重要的问题就在于批次效应，任何一个试验步...
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scRNA-使用sctransform去除批次效应刘小泽写于19.10.10上一次介绍了使用Seurat 的merge函数来合并4个样本（各有2个生物学重复）的8组数据，但是merge只是将原始...
专题公告
单细胞测序转录组相关+VDJ相关
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