# 安装 ## 编译 ## 或者使用conda 上面从源码编译的方法太慢，或访问github网络不稳定情况下，可以使用conda； ## 检查安...
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star: 比对RNA-seq到参考基因组获取剪切事件
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salmon：从RNA-seq数据中定量转录本
Salmon 主要用于从RNA-seq数据中计算转录本的丰度。 # 安装 # 基于Salmon分析RNAseq数据 ## 获取转录组和建立索引 ...
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ChIPpeakAnno 注释peak# 1. 初步使用 运行下面几行代码，初步了解ChIPpeakAnno使用 # 2. 详细使用例子 ChIPpeakAnno使用GRanges ...
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GFF或GTF格式转bed
# 1. gff2bed和gtf2bed[#1-%E8%BF%99%E6%98%AF%E4%B8%80%E7%BA%A7%E6%A0%87%E9...
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encode eclip 数据分析流程
# 准备： 测序数据：fastq格式；RBFOX2 HepG2测序数据 - RBFOX2[https://s3-us-west-1.amazon...
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pyBigWig处理bigwig
pyBigWig[https://github.com/deeptools/pyBigWig]是用C编写的调用libBigWig库的python...
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bw-python处理bigwig
bw-python[https://github.com/brentp/bw-python]是一个包装了 Devon Ryan's bigwig...
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libBigWig处理bigwig
libBigWig[https://github.com/dpryan79/libBigWig]是一个用于读取/解析bigWig和bigBed文...
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Seurat分析10x Visium空间转录组数据本教程使用Seurat包进行10x Visium单细胞空间转录组数据分析。 这个教程涉及： 标准化 降维和聚类 检测空间差异表达基因 交互可视化...
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Seurat分析Slide-seq空间转录组此教程是使用Seurat分析 Slide-seq v2[https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020...
专题公告
札记分享：生物信息学，统计学，算法。。。。。。
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